Это команда gt-seqstat, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
gt-seqstat - Рассчитывает статистику для файлов fasta.
СИНТАКСИС
gt секстат [параметры] файл [...]
ОПИСАНИЕ
-v [да | нет]
быть подробным (по умолчанию: нет)
-раскрытый [да | нет]
показать распределение длины последовательности (по умолчанию: нет)
-b [ценностное ]
размер корзины для опции distlen (по умолчанию: 100)
-двоичный [да | нет]
используйте двоичный формат для имени файла вывода distlen: .distlen
bucketsize: 1 (по умолчанию: нет)
-контиги [да | нет]
сводка статистики набора контигов (по умолчанию: да)
-растяжка [да | нет]
показать распределение A-подстрок (по умолчанию: нет)
-геном [ценностное ]
установить длину генома для расчета NG50 / NG80 (по умолчанию: 0)
-Помощь
отобразить справку по основным параметрам и выйти
-help +
отобразить справку по всем параметрам и выйти
-версия
отобразить информацию о версии и выйти
СОСТАВЛЕНИЕ ОТЧЕТОВ ОШИБКИ
Сообщайте об ошибкахgt-users@genometools.org>.
Используйте gt-seqstat онлайн с помощью сервисов onworks.net