นี่คือคำสั่ง gt-matchtool ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
gt-matchtool - แยกวิเคราะห์รูปแบบการจับคู่และ/หรือเรียกใช้เครื่องมือจับคู่
เรื่องย่อ
gt ไม้ขีดไฟ [ตัวเลือก ...]
DESCRIPTION
ประเภท [...]
เลือกรูปแบบไฟล์ที่ตรงกัน: OPENMATCH: เปิด การจับคู่ รูปแบบ เช่น vmatch BLASTOUT : tabular
เอาต์พุต BLAST (-m 8) BLASTALLP: เรียกใช้ BLASTALL ด้วย blastp BLASTALLN: เรียกใช้ BLASTALL
ด้วย blastn BLASTP : เรียกใช้ blastp BLASTN : เรียกใช้ blastn LAST : เรียกใช้ LAST SW : ใช้
Smith-Waterman (ค่าเริ่มต้น: OPENMATCH)
-matchfile [ชื่อไฟล์]
ตั้งชื่อไฟล์อินพุต (ค่าเริ่มต้น: ไม่ได้กำหนด)
-ฐานข้อมูล [ชื่อไฟล์]
ตั้งชื่อไฟล์ฐานข้อมูล (ค่าเริ่มต้น: undefined)
-ว่ายน้ำ [ความคุ้มค่า]
กำหนดความยาวการจัดตำแหน่งขั้นต่ำที่ต้องการ (สำหรับการจัดตำแหน่ง Smith-Waterman) (ค่าเริ่มต้น: 10)
-swmaxedist [ความคุ้มค่า]
กำหนดระยะการแก้ไขสูงสุดที่อนุญาต (สำหรับการจัดตำแหน่ง Smith-Waterman) (ค่าเริ่มต้น: 0)
แบบสอบถาม [ชื่อไฟล์]
ตั้งชื่อไฟล์แบบสอบถาม (ค่าเริ่มต้น: ไม่ได้กำหนด)
-ช่วยด้วย
แสดงความช่วยเหลือและออก
-version
แสดงข้อมูลเวอร์ชันและออก
รายงาน ข้อบกพร่อง
รายงานจุดบกพร่องไปที่gt-users@genometools.org>.
ใช้ gt-matchtool ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net