นี่คือแอป Linux ชื่อ COGsoft ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดเป็น COGsoft.04.19.2012.tgz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ทางออนไลน์ที่ชื่อว่า COGsoft พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
COGsoft
Ad
DESCRIPTION
ซอฟต์แวร์สำหรับสร้าง Clusters of Orthologous Groups (มีอัลกอริธึม EdgeSearch ใหม่) อ้างอิงล่าสุด: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. Bioinformatics 2010คุณสมบัติ
- คำอธิบายของจุดแข็ง/จุดอ่อนของวิธีการต่างๆ: Kristensen DM, Wolf YI, Mushegian AR, Koonin EV วิธีการคำนวณสำหรับการอนุมานวิทยายีน Bioinform สั้น ๆ 2011 ก.ย.;12(5):379-91. Epub 2011 19 มิ.ย. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21690100
- การอ้างอิงอัลกอริทึม: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. อัลกอริธึมพหุนามต่ำสำหรับการประกอบคลัสเตอร์ของกลุ่ม orthologous จากการจับคู่ที่ดีที่สุดที่สมมาตรระหว่างกัน ชีวสารสนเทศศาสตร์ 2010 มิ.ย. 15;26(12):1481-7. Epub 2010 2 พฤษภาคม http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btq229?ijkey=zD7TIWnncGvDGYE&keytype=ref
- ดี/ทบทวนอย่างละเอียดของ orthologs/COGs: Koonin EV. ออร์โธล็อก พาราล็อก และจีโนมวิวัฒนาการ Annu รายได้ Genet. 2005;39:309-38. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16285863
- กระดาษ COG ต้นฉบับ: Tatusov RL, Koonin EV, Lipman DJ มุมมองจีโนมในครอบครัวโปรตีน ศาสตร์. 1997 ต.ค. 24;278(5338):631-7. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9381173
- ฐานข้อมูล COG: Tatusov RL, Galperin MY, Natale DA, Koonin EV ฐานข้อมูล COG: เครื่องมือสำหรับการวิเคราะห์ระดับจีโนมของฟังก์ชันและวิวัฒนาการของโปรตีน กรดนิวคลีอิก 2000 ม.ค. 1;28(1):33-6. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10592175
- เว็บเพจ Koonin lab: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/groups/koonin/
- เว็บไซต์ FTP อย่างเป็นทางการ: ftp.ncbi.nih.gov/pub/wolf/COGs/COGsoft/ (แม้ว่าในขณะนี้ readme จะชี้ไปที่หน้า sourceforge)
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
บรรทัดคำสั่ง
ภาษาโปรแกรม
C + +
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/cogtriangles/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
