Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen arden-analiz komutudur.
Program:
ADI
arden-analiz - yapay referans genom haritalamasının sonuçlarını analiz edin
SİNOPSİS
arden-analiz [seçenekleri] [GİRİŞ DOSYA] [ÇIKTI DOSYASI] ...
TANIM
Yapay referans genom eşlemesinin sonuçlarını analiz etmek için komut dosyası. Bu komut dosyası
belirli bir veri kümesindeki varsayılan TP'leri / FP'leri tanımlar (okur).
SEÇENEKLER
ÇIKTI DOSYASI
çıkış hedef klasörünün yolu.
GİRİŞ DOSYA
ini dosyasına ppath. Gerekli formatı elde etmek için örnek dosyalara bakın.
--versiyon
programın sürüm numarasını göster ve çık
-h, --yardım et
bu yardım mesajını göster ve çık
-p PHRED, --phred=PHRED
Girdi okumalarının PHRED kodlamasını belirtin, yani Illumina 1.3+ = -p 33.[varsayılan:
33]
-r RÜTBE, --dahili sıralama=RANK
Okumalar için dahili sıralamayı kullanın (okunan adlar okunamıyorsa gereklidir)
sözlükbilimsel olarak python'da ve işletim sisteminizde sam ile aynı şekilde sıralanabilir
araçlar).[varsayılan:1]
onworks.net hizmetlerini kullanarak arden-analyze'i çevrimiçi kullanın