Це команда ecogrep, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
ecogrep - фільтрація результату ecoPCR на основі таксономічного фільтра ідентифікатора та регулярного виразу
модель
СИНТАКСИС
екогреп [параметри] ім'я файлу
ОПИС
ecoPCR — це електронне програмне забезпечення для ПЛР, розроблене LECA та Helix-Project. Це допомагає
оцінити якість праймерів штрих-коду.
Ця програма належить до пакету exoPCR.
ВАРІАНТИ
-1 : [ПЕРШИЙ] : порівняйте дану модель з олігонуклеотидом прямого ланцюга
-2 : [ДРУГИЙ] : порівняйте дану модель з олігонуклеотидом зворотного ланцюга
-d : [D]база даних, що містить таксономічну інформацію
-e : [E]rrors: максимальна дозволена помилка під час відповідності шаблону (варіант-1, -2 та -p) (0 від
за замовчуванням)
-p : [P]шаблон : олігонуклеотидний малюнок
-h : [Довідка]: роздрукувати допомогти
-i : [Я]ігнорую піддерево під заданим таксономічним ідентифікатором
-r : [R]обмежити пошук піддеревом за заданим таксомічним ідентифікатором
-v : увімкнути відчуття відповідності, щоб вибрати невідповідні рядки.
Аргумент:
Ім'я вихідного файлу ecoPCR
Використовуйте ecogrep онлайн за допомогою служб onworks.net