Це програма для Linux під назвою COGsoft, останню версію якої можна завантажити як COGsoft.04.19.2012.tgz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою COGsoft з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
COGsoft
Ad
ОПИС
Програмне забезпечення для створення кластерів ортологічних груп (з новим алгоритмом EdgeSearch). Останній реф: Крістенсен Д.М., Каннан Л., Коулман М.К., Вольф Ю.І., Сорокін А., Кунін Є.В., Мушегян А. Біоінформатика 2010.Функції
- Опис сильних і слабких сторін різних методів: Крістенсен Д.М., Вольф Ю.І., Мушегян А.Р., Кунін Є.В. Обчислювальні методи для висновку генної ортології. Коротка біоінформація. 2011 вересень;12(5):379-91. Epub 2011 19 червня. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21690100
- Посилання на алгоритм: Крістенсен Д.М., Каннан Л., Коулман М.К., Вольф Ю.І., Сорокін А., Кунін Є.В., Мушегіан А. Низькополіноміальний алгоритм складання кластерів ортологічних груп із міжгеномних симетричних найкращих збігів. Біоінформатика. 2010 15 червня; 26(12):1481-7. Epub 2010 2 травня. http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btq229?ijkey=zD7TIWnncGvDGYE&keytype=ref
- Хороший/повний огляд ортологів/КОГ: Кунін Є.В. Ортологи, паралоги та еволюційна геноміка. Анну преподобний Жене. 2005;39:309-38. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16285863
- Оригінальна робота COG: Татусов Р.Л., Кунін Є.В., Ліпман Д.Д. Геномний погляд на сімейства білків. наук. 1997, 24 жовтня; 278 (5338): 631-7. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9381173
- База даних COG: Татусов Р.Л., Гальперін М.Ю., Натале Д.А., Кунін Є.В. База даних COG: інструмент для аналізу функцій і еволюції білка в масштабі генома. Нуклеїнові кислоти Res. 2000 січня 1;28(1):33-6. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10592175
- Веб-сторінка лабораторії Куніна: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/groups/koonin/
- Офіційний сайт FTP: ftp.ncbi.nih.gov/pub/wolf/COGs/COGsoft/ (хоча на даний момент readme просто вказує на сторінку sourceforge)
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
C + +
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/cogtriangles/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
