Đây là lệnh edialigne có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
edialign - Căn chỉnh nhiều trình tự cục bộ
SYNOPSIS
căn chỉnh -câu lệnh bộ tiếp theo -nucmode -revcomp boolean [-chồng chéo lựa chọn]
[-liên kết ] [-maxfragl số nguyên] -framat boolean -fragsim số nguyên
[-score boolean] [-ngưỡng phao] -mặt nạ boolean -dostars boolean
-sao số nguyên -outfile ô uế -outseq phần tiếp theo
căn chỉnh -Cứu giúp
MÔ TẢ
căn chỉnh là một chương trình dòng lệnh từ EMBOSS (“Tổ chức Sinh học Phân tử Châu Âu Mở rộng
Bộ phần mềm"). Nó là một phần của (các) nhóm lệnh "Alignment: Multiple".
LỰA CHỌN
Đầu vào phần
-câu lệnh bộ tiếp theo
thêm vào phần
-nucmode
Chế độ căn chỉnh trình tự axit nucleic (đơn giản, dịch hoặc hỗn hợp) Giá trị mặc định: n
-revcomp boolean
Giá trị mặc định: N
-chồng chéo lựa chọn
Theo mặc định, trọng số chồng chéo được sử dụng khi Nseq = <35 nhưng bạn có thể đặt giá trị này thành 'có' hoặc
'no' Giá trị mặc định: default (khi Nseq = <35)
-liên kết
Phương pháp phân cụm để xây dựng cây trình tự (UPGMA, liên kết tối thiểu hoặc tối đa
liên kết) Giá trị mặc định: UPGMA
-maxfragl số nguyên
Giá trị mặc định: 40
-framat boolean
Giá trị mặc định: N
-fragsim số nguyên
Giá trị mặc định: 4
-score boolean
Giá trị mặc định: N
-ngưỡng phao
Giá trị mặc định: 0.0
Đầu ra phần
-mặt nạ boolean
Giá trị mặc định: N
-dostars boolean
Giá trị mặc định: N
-sao số nguyên
Giá trị mặc định: 4
-outfile ô uế
-outseq phần tiếp theo
Sử dụng edialigne trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net