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fdk - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 fdk

这是命令 fdk,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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fdk - 使用 FDK 算法从投影重建锥束

FDK 一词指的是撰写开创性论文的作者 Feldkamp、Davis 和 Kress
1984 年的“实用锥束算法”。他们的论文描述了一种滤波反投影
锥束几何的重建算法。 plastimatch 中的 fdk 程序是一个
FDK算法的实现

FDK 用法


fdk 程序以 2D 投影图像的目录作为输入,并生成单个
3D 体积作为输出。

命令行用法是:

用法:fdk [选项]
选项:
-A 硬件 “cpu”或“cuda”(默认=cpu)
-a "num((num) num)" 使用这个范围的图像
-r "r1 r2 r3" 设置输出分辨率(以体素为单位)
-f 过滤器“无”或“斜坡”(默认=斜坡)
-s scale 缩放输出文件的强度
-z "s1 s2 s3" 重建的物理尺寸(以毫米为单位)
-I indir 输入目录
-O outfile 输出文件

通过跟随教程可以最好地理解 fdk 程序的用法:
fdk_教程_ifdk_教程_ii.

INPUT FILES


支持三种不同格式的输入文件。 这些是:

· pfm 格式的图像文件与 geomtry txt 文件

· 原始格式的图像文件与几何 txt 文件

· 瓦里安 hnd 文件

pfm 和原始文件类似,它们将图像存储为 4 字节的数组
小端浮点数。 唯一的区别是 pfm 文件有一个存储
图像大小,而原始文件则没有。

每个 pfm 或原始图像文件必须在与 .txt 相同的目录中有一个几何文件
延期。 例如,如果您想在重建中使用 image_0000.pfm,您应该
提供另一个包含几何图形的文件 image_0000.txt。 简要说明
几何文件格式在 proj_mat_文件_格式.

文件序列应与模式一起存储:
XXXXYYYY.ZZZ

其中 XXXX 是前缀,YYYY 是数字,.ZZZ 是已知类型的扩展名
(.hnd、.pfm 或 .raw)。

例如,以下是 pfm 文件的良好目录布局:

文件/image_00.pfm
文件/image_00.txt
文件/image_01.pfm
文件/image_01.txt
等等......

Varian hnd 文件应存储在原始布局中。 例如:

文件/ProjectionInfo.xml
文件/Scan0/Proj_0000.hnd
文件/Scan0/Proj_0001.hnd
等等......

从 Varian hnd 格式重建不需要几何 txt 文件。

图像 几何


默认情况下,当您生成 DRR 时,图像的方向就好像虚拟 X 射线源
是一台照相机。 这意味着对于右侧胶片,图像的列来自
inf 到 sup,行从 ant 到 post。 瓦里安 OBI 系统生成 HND 文件,
方向不同。 对于右侧底片,HND 图像的列
从 ant 到 post,行从 sup 到 inf。 显示了此想法的说明
在下图中。
[图像] 瓦里安 HND 文件的几何形状。UNINDENT

使用 onworks.net 服务在线使用 fdk


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