LAdump - 云端在线

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LAdump - 以简单的格式显示 daligner 局部对齐

概要


转储 [-CDT[-o] src1:db|坝 [ src2:db|坝 ] 对齐:激光 [ 读取:文件 | 阅读:范围 ...]

商品描述


喜欢 洛杉矶秀(1) 转储 允许显示一个子集的局部对齐 (LA)
堆积在 .las 文件中,然后选择要显示的有关它们的信息。 区别在于
信息以非常简单的“1 码”ASCII 格式编写,这使得它很容易
供人阅读和解析信息以供进一步使用。 对于每个 LA,这对读数
是一行输出。 -c 请求进一步输出 LA 的坐标
段被输出。 这 -d 选项要求 LA 中的差异数为
输出,和 -t 请求输出跟踪点信息。 最后, -o 要求
只有正确重叠的 LA 才会被输出。

格式非常简单。 每条请求的信息都出现在一行上。 这
每行的第一个字符是一个“1-code”字符,它告诉您要输入哪些信息
期待上线。 该行的其余部分包含每个项目所在的信息
由一个空格分隔。 跟踪点线给出了跟踪点的数量
LA 中的间隔,紧随其后的是包含一对
给出每个连续跟踪点中的差异和 b 位移的整数
间隔。

P #a #b - (#a,#b) 在它们之间有一个 LA
C #ab #ae #bb #be - [#ab,#ae] 与 [#bb,#be] 对齐
D # - 洛杉矶有 # 处不同
T #n - LA 有 #n 个跟踪点间隔
(#d #y )^#n - 将 B 的 #y bp's 与
A 的下一个固定大小区间
+ X # - X 的总量(X = P 或 T)
% X # - 任何堆中 X 的最大数量(X = P 或 T)
@ T # - 任何跟踪中的最大跟踪点数

以 +、% 或 @ 开头的 1 代码行始终是输出中的第一行。 他们
给出关于输出中包含的内容的大小信息。 具体来说, '+ X #' 给出
LA 的总数 (X=P),或跟踪点间隔的总数 (X=T)
文件 。 '%X#' 给出最大 LA 数(X=P)或最大跟踪点数
给定的区间 (X=T) 堆积 (所有具有相同 a-read 的 LA 的集合(仅适用于
to sorted 最后@T # 给出了在任何跟踪中的最大跟踪点间隔
文件。

使用 onworks.net 服务在线使用 LAdump



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