SWAPHI-LS:Linux 版 Xeon Phi 集群上的对齐下载

这是名为 SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。

 
 

下载并在线运行这个名为 SWAPHI-LS 的应用程序: Alignment on Xeon Phi Cluster with OnWorks 免费。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序,安装并运行。

SWAPHI-LS:Xeon Phi 集群上的对齐



描述:

第一个并行 Smith-Waterman 算法利用英特尔至强融核集群来加速长 DNA 序列的对齐。 该算法是用 C++(带有一组 SIMD 内在扩展)、OpenMP 和 MPI 编写的。 性能评估表明,我们的算法实现了非常稳定的性能,在单个 Xeon Phi 上产生高达 30.1 GCUPS 的性能,在共享主机的四个 Xeon Phi 上产生高达 111.4 GCUPS 的性能。

目的

学术/科研


用户界面

控制台/终端,命令行


程式语言

C + +中



这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。



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