Il s'agit de l'application Linux nommée iPiG à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom ipig_r5.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée iPiG pour fonctionner sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN:
iPiG pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION:
iPiG cible l'intégration de correspondances de spectre de peptides (PSM) à partir de la spectrométrie de masse (MS)identifications de peptides dans les visualisations génomiques fournies par le navigateur génomique tel que le navigateur génomique UCSC (http://genome.ucsc.edu/).
iPiG prend les PSM du format standard MS mzIdentML (*.mzid) ou au format texte et fournit des résultats dans les formats de suivi du génome (fichiers BED et GFF3), qui peuvent être facilement importés dans les navigateurs génomiques.
Pour plus de détails sur iPiG et ses fonctionnalités, veuillez consulter
« iPiG : intégration des correspondances de spectre de peptides dans les visualisations du navigateur du génome »
Mathias Kuhring et Bernhard Y. Renard
(http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0050246)
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Java Swing, console/terminal
Langage de programmation
Java
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/ipig/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.