Il s'agit de l'application Windows nommée iPiG pour s'exécuter sous Windows en ligne sur Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom ipig_r5.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée iPiG pour une exécution gratuite sous Windows en ligne sur Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN:
iPiG pour fonctionner sous Windows en ligne sur Linux en ligne
DESCRIPTION:
iPiG cible l'intégration de correspondances de spectre de peptides (PSM) à partir de la spectrométrie de masse (MS)identifications de peptides dans les visualisations génomiques fournies par le navigateur génomique tel que le navigateur génomique UCSC (http://genome.ucsc.edu/).
iPiG prend les PSM du format standard MS mzIdentML (*.mzid) ou au format texte et fournit des résultats dans les formats de suivi du génome (fichiers BED et GFF3), qui peuvent être facilement importés dans les navigateurs génomiques.
Pour plus de détails sur iPiG et ses fonctionnalités, veuillez consulter
« iPiG : intégration des correspondances de spectre de peptides dans les visualisations du navigateur du génome »
Mathias Kuhring et Bernhard Y. Renard
(http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0050246)
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Java Swing, console/terminal
Langage de programmation
Java
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/ipig/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.