Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന കമാൻഡ് ഫാമാപ്പാണിത്.
പട്ടിക:
NAME
famap - വീണ്ടും PCR തിരയലുകൾക്കായി ഫാസ്റ്റ സീക്വൻസ് ഡാറ്റാബേസ് തയ്യാറാക്കുക
സിനോപ്സിസ്
famap [-hV] -b mmapped-file [-t cvt] [fafile ...]
famap [-hV] -d mmapped-file [ord ...]
famap [-hV] -l mmapped-file [ord ...]
വിവരണം
പരിപാടി famap ഇ-പിസിആർ സ്യൂട്ടിന്റെ ഭാഗമാണ്, ഫാസ്റ്റയിൽ നിന്ന് മാപ്പ് ചെയ്ത ഫയൽ നിർമ്മിക്കാൻ ഇത് ഉപയോഗിക്കുന്നു
റിവേഴ്സ് ഇ-പിസിആർ തിരയലുകൾക്കുള്ള ഫയലുകൾ
ഓപ്ഷനുകൾ
cvt (പരിവർത്തന പട്ടിക) ഇതിൽ ഒന്നാണ്:
ഓഫ് - പോലെ (സ്ഥിരസ്ഥിതി)
n - ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് [acgtnACGTN] അനുവദനീയമാണ്,
N - ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് വലിയക്ഷരം അനുവദനീയമാണ് [ACGTN]
nx - അവ്യക്തത കോഡുകളുള്ള ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് അനുവദനീയമാണ്
NX - ന്യൂക്ലിയോടൈഡ്, അവ്യക്തത കോഡുകൾ വലിയക്ഷരം
ഉദാഹരണം
famap -tN -b genome.famap org/chr_*.fa
fahash -b genome.hash -w 12 -f3 ${PWD}/genome.famap
re-PCR -s genome.hash -n1 -g1 ACTATTGATGATGA AGGTAGATGTTTT 120-200
കാണുക famap(1) ഉം വീണ്ടും പിസിആർ(1)
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഓൺലൈനായി ഫാമാപ്പ് ഉപയോഗിക്കുക