famap - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന കമാൻഡ് ഫാമാപ്പാണിത്.

പട്ടിക:

NAME


famap - വീണ്ടും PCR തിരയലുകൾക്കായി ഫാസ്റ്റ സീക്വൻസ് ഡാറ്റാബേസ് തയ്യാറാക്കുക

സിനോപ്സിസ്


famap [-hV] -b mmapped-file [-t cvt] [fafile ...]

famap [-hV] -d mmapped-file [ord ...]

famap [-hV] -l mmapped-file [ord ...]

വിവരണം


പരിപാടി famap ഇ-പിസിആർ സ്യൂട്ടിന്റെ ഭാഗമാണ്, ഫാസ്റ്റയിൽ നിന്ന് മാപ്പ് ചെയ്ത ഫയൽ നിർമ്മിക്കാൻ ഇത് ഉപയോഗിക്കുന്നു
റിവേഴ്സ് ഇ-പിസിആർ തിരയലുകൾക്കുള്ള ഫയലുകൾ

ഓപ്ഷനുകൾ


cvt (പരിവർത്തന പട്ടിക) ഇതിൽ ഒന്നാണ്:

ഓഫ് - പോലെ (സ്ഥിരസ്ഥിതി)

n - ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് [acgtnACGTN] അനുവദനീയമാണ്,

N - ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് വലിയക്ഷരം അനുവദനീയമാണ് [ACGTN]

nx - അവ്യക്തത കോഡുകളുള്ള ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് അനുവദനീയമാണ്

NX - ന്യൂക്ലിയോടൈഡ്, അവ്യക്തത കോഡുകൾ വലിയക്ഷരം

ഉദാഹരണം


famap -tN -b genome.famap org/chr_*.fa

fahash -b genome.hash -w 12 -f3 ${PWD}/genome.famap

re-PCR -s genome.hash -n1 -g1 ACTATTGATGATGA AGGTAGATGTTTT 120-200

കാണുക famap(1) ഉം വീണ്ടും പിസിആർ(1)

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഓൺലൈനായി ഫാമാപ്പ് ഉപയോഗിക്കുക



ഏറ്റവും പുതിയ ലിനക്സ്, വിൻഡോസ് ഓൺലൈൻ പ്രോഗ്രാമുകൾ