angielskifrancuskiniemieckiwłoskiportugalskirosyjskihiszpański

Ulubiona usługa OnWorks

masai_mapper - Online w chmurze

Uruchom masai_mapper u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przez Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS

To jest polecenie masai_mapper, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu darmowych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS

PROGRAM:

IMIĘ


masai_mapper - Masajski twórca map

STRESZCZENIE

masai_mapper [OPCJE]

OPIS

Masai jest szybkim i dokładnym maperem odczytu opartym na przybliżonych nasionach i wielokrotnościach
cofanie się.

Widzieć http://www.seqan.de/projects/masai po więcej informacji.

(c) Prawa autorskie 2011-2012 przez Enrico Siragusa.

-h, --help

Wyświetla ten komunikat pomocy.

--wersja

Wyświetlanie informacji o wersji

Opcje mapowania:

-mm, --tryb mapowania STR

Wybierz tryb mapowania. Jeden ze wszystkich, najlepszy i najlepszy. Domyślnie: dowolna najlepsza.

-mb, --blok mapowania NUM

Maksymalna liczba odczytów do mapowania naraz. W zakresie [10000..inf]. Domyślny:
10.

-e, --błędy NUM

Maksymalna liczba błędów na odczyt. W zakresie [0..32]. Domyślnie: 5.

-sl, -- długość-nasiona NUM

Minimalna długość nasion. W zakresie [10..100]. Domyślnie: 33.

-ng, --bez przerw

Nie wyrównuj odczytów z przerwami.

Opcje indeksu genomu:

-x, --indeks STR

Wybierz typ indeksu genomu. Jeden z esa, sa, qgram i fm. Domyślnie: sa.

-xp, --indeks-przedrostek STR

Podaj nazwę prefiksu indeksu genomu. Domyślnie: użyj prefiksu nazwy pliku genomu.

Opcje wyjściowe:

-o, --plik wyjściowy FILE

Określ plik wyjściowy. Domyślnie: użyj prefiksu nazwy pliku reads. Prawidłowe typy plików
są: surowe i sam.

-nc, --nie-cygaro

Nie wyprowadzaj ciągu CIGAR. Ma to wpływ tylko na wyjście SAM.

Opcje debugowania:

-nv, --nie-weryfikuj

Nie weryfikuj trafień w nasiona.

-NS, --no-dump

Nie zrzucaj wyników.

-nm, --brak-wielokrotności

Wyłącz wielokrotne cofanie.

WERSJA

masai_mapper wersja: 0.7.1 [14053] Ostatnia aktualizacja 2013

Korzystaj z masai_mapper online za pomocą usług onworks.net


Ad


Ad

Najnowsze programy online dla systemów Linux i Windows