To jest polecenie masai_output_pe, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
masai_output_pe — Masai Output — sparowany tryb zakończenia
STRESZCZENIE
masai_output_pe [OPCJE]
OPIS
Masai jest szybkim i dokładnym maperem odczytu opartym na przybliżonych nasionach i wielokrotnościach
cofanie się.
See http://www.seqan.de/projects/masai po więcej informacji.
(c) Prawa autorskie 2011-2012 przez Enrico Siragusa.
-h, --help
Wyświetla ten komunikat pomocy.
--wersja
Wyświetlanie informacji o wersji
Opcje parowania:
-ng, --bez przerw
Nie wyrównuj odczytów z przerwami.
-NS, --biblioteka-długość NUM
Długość biblioteki. Domyślnie: 220.
Im, --błąd-biblioteki NUM
Tolerancja długości biblioteki. Domyślnie: 50.
Opcje wyjściowe:
-t, --tmp-folder STR
Określ ogromny folder tymczasowy. Domyślnie: użyj folderu genomu.
-o, --plik wyjściowy FILE
Określ plik wyjściowy. Domyślnie: użyj prefiksu nazwy pliku reads. Prawidłowe typy plików
są: surowe i sam.
-nc, --nie-cygaro
Nie wyprowadzaj ciągu CIGAR. Ma to wpływ tylko na wyjście SAM.
Opcje debugowania:
-NS, --bez zrzutu
Nie zrzucaj wyników.
WERSJA
masai_output_pe wersja: 0.7.1 [14053] Ostatnia aktualizacja 2013
Korzystaj z masai_output_pe online za pomocą usług onworks.net
