Это команда bp_tree2pagp, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
bp_tree2pag - конвертировать деревья разбираемого формата Bio :: TreeIO в формат pagel
СИНТАКСИС
bp_tree2pag -if nexus -i file.nexus> file.pag
# ИЛИ передать через STDIN и использовать вместо этого формат newick
кот file.newick | bp_tree2pag -if newick> file.nh
# ИЛИ укажите вывод и ввод
bp_tree2pag -o файл.pag -i файл.newick
ОПИСАНИЕ
Преобразование анализируемых файлов TreeIO в файлы дерева формата Pagel. Имейте в виду, что формат pagel
действительно поддерживает только одно дерево для каждого файла, поэтому. Также парсинг Pagel пока недоступен
в биоперл.
Используйте bp_tree2pagp онлайн с помощью сервисов onworks.net