Ito ang command maskAlignedReads na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
maskAlignedReads.py - Mask aligned reads sa file ng mga rehiyon
DESCRIPTION
paggamit: maskAalignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
Gamitin ang in.cmp.h5 upang i-mask ang mga kaukulang rehiyon ng mga file sa in.rgn.h5, isulat ang output sa isang bagong
rgn.fofn.
posibilidad mga argumento:
inCmpFile
Isang input cmp.h5 file.
inRgnFofn
Isang fofn ng input region table files.
outRgnFofn
Isang fofn ng output region table files.
opsyonal mga argumento:
-h, - Tumulong
ipakita ang mensahe ng tulong na ito at lumabas
-v, --bersyon
ipakita ang numero ng bersyon ng programa at lumabas
-l LOGFILE, --logFile LOGFILE
Tukuyin ang isang file upang mag-log sa. Default sa stderr. (default: Wala)
-d, --debug
Pinapataas ang verbosity ng pag-log (default: False)
-i, --impormasyon
Ipakita ang mga entry sa log ng impormasyon (default: False)
Gumamit ng maskAlignedReads online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net