Це програма для Linux під назвою iPiG для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як ipig_r5.zip. Його можна запустити в режимі онлайн у постачальника безкоштовного хостингу OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою iPiG, щоб безкоштовно запускати в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
СКРЕНИ:
iPiG для запуску в Linux онлайн
ОПИС:
iPiG націлений на інтеграцію збігів пептидного спектру (PSM) з мас-спектрометрії (MS)ідентифікації пептидів у візуалізації генома, надані браузером геному, таким як браузер геному UCSC (http://genome.ucsc.edu/).
iPiG бере PSM із стандартного формату MS mzIdentML (*.mzid) або у текстовому форматі та надає результати у форматах відстеження геному (файли BED і GFF3), які можна легко імпортувати в браузери геному.
Щоб дізнатися більше про iPiG та його функціональність, див
"iPiG: інтеграція збігів пептидного спектру у візуалізації браузера генома"
Матіас Курінг і Бернхард Ю. Ренар
(http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0050246)
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Java Swing, консоль/термінал
Мова програмування
Java
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/ipig/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.