这是 bp_split_seqp 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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bp_split_seq - 将一个序列分割成大小相等的块,并带有一个可选的
重叠范围
概要
bp_split_seq -c 10000 [-o 1000] [-i] -f seq.in
商品描述
该脚本将序列分成块
强制选项:
-c 结果序列的所需长度。
-f 输入文件(必须是 FASTA 格式)。
特殊选项:
-o 结果序列之间的重叠范围。
-i 使用生成的序列文件创建索引文件。 这是
如果您想将此列表作为输入参数传递给
另一个程序(即 CLUSTAL、HMMER 等)。
信息反馈
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用户反馈是该模块和其他 Bioperl 模块演变过程中不可或缺的一部分。 发送
您的意见和建议最好发送到 Bioperl 邮件列表。 您的参与
非常感谢。
bioperl-l@bioperl.org - 一般讨论;一般交流
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - 关于邮件列表
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解析度。 错误报告可以通过网络提交:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
作者
伊万·伯尼birney-at-ebi.ac.ukE
毛里西奥·埃雷拉·夸德拉 E 毛里西奥在 open-bio.orgE
(一些增强)
使用 onworks.net 服务在线使用 bp_split_seqp