هذا هو الأمر checktranse الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
checktrans - تقارير رموز STOP وإحصائيات ORF للبروتين
موجز
com.checktrans -تسلسل seqall -orfml عدد صحيح [-addlast منطقية] -ملف ملف
-تسق com.seqoutall -تصميم تميز
com.checktrans -مساعدة
الوصف
com.checktrans هو برنامج سطر أوامر من EMBOSS ("البيولوجيا الجزيئية الأوروبية المفتوحة
مجموعة برامج"). وهو جزء من أمر "Nucleic:Gene Find,Nucleic:Translation".
مجموعات).
OPTIONS
إدخال قسم
-تسلسل seqall
مطلوب: قسم
-orfml عدد صحيح
القيمة الافتراضية: 100
إضافي قسم
-addlast منطقية
تشير العلامة النجمية في تسلسل البروتين إلى موضع كودون STOP. Checktrans
يفترض أن جميع ORFs تنتهي بكودون STOP. إجبار التسلسل على الانتهاء بـ
العلامة النجمية، إذا لم تكن هناك واحدة بالفعل، تجعل checktrans تتعامل مع النهاية على أنها a
ORF المحتملة. إذا تمت إضافة علامة النجمة، فلن يتم تضمينها في العدد المبلغ عنه
توقف. القيمة الافتراضية: Y
الناتج قسم
-ملف ملف
-تسق com.seqoutall
ملف تسلسلي للاحتفاظ بتسلسلات ORF للإخراج
-تصميم تميز
ملف لميزات الإخراج
استخدم checktranse عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
