هذا هو الأمر fa2dna الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
fa2dna - تنسيق قاعدة بيانات fasta للاستخدام مع ANFO
موجز
fa2dna [ خيار | ملف ]
الوصف
fa2dna يقرأ ملفًا واحدًا أو أكثر بتنسيق fasta ويعيد تنسيقها إلى قاعدة بيانات مناسبة
For معلومات(1). يمكن أن يحتوي ملف (ملفات) الإدخال على أكثر من تسلسل واحد، ويمكن أن يحتوي كل تسلسل على ذلك
يمكن تقسيمها إلى contigs متعددة بامتداد Ns. جميع رموز الغموض IUPAC هي
بدعم كامل.
OPTIONS
-V ، - الإصدار
اطبع رقم النسخة واخرج.
-o ملف ، - ملف الإخراج
كتابة الإخراج إلى ملف.ملف يجب أن تنتهي في .الحمض النووي، لان معلومات وبعض المصب
قد تتعثر الأدوات على امتداد مختلف. الافتراضي هو اسم الجينوم مع
ال .الحمض النووي تمديد.
-م ن، --ماكس ن
يضبط الحد الأقصى لعدد Nيجب تفسيرها على أنها رموز غموض IUPAC N؛ أي
يتم تفسير الامتداد الأطول على أنه فصل contigs. الافتراضي هو 2.
اسم -g، - اسم الجينوم
يضبط اسم الجينوم على الاسم. يتم تخزين هذا الاسم في ملف الإخراج وسوف يكون
استعمل من قبل معلومات للتعرف على الجينوم المطابق في مخرجاته. يجب أن يكون الجينوم أ
بادئة اسم ملف الإخراج للسماح لأدوات المصب بالعثور عليه. الاسم
يجب أن تكون قصيرة، ولكنها فريدة من نوعها، مثل "hg18" أو "pt2" للإنسان أو الشمبانزي
الجينومات ستعمل بشكل جيد.
-د النص، -نص الوصف
يضيف نص كوصف للبيانات الوصفية. هذه معلوماتية بحتة.
-v ، - الإسراف
يؤدي إلى طباعة مؤشر التقدم.
استخدم fa2dna عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
