هذه هي فجوة الأوامر 5 التي يمكن تشغيلها في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
gap5 - برنامج تجميع الجينوم (جزء من حزمة ستادن)
موجز
gap5 [-ر] [- ماكس ] [-ماكسدب ] [-تخطي_الملاحظات] [DATABASE_NAME.V]
الوصف
Gap5 هو برنامج تجميع الجينوم. يحتوي البرنامج على جميع الأدوات التي من شأنها أن تكون
متوقع من برنامج تجميع بالإضافة إلى العديد من الميزات الفريدة وسهلة الاستخدام للغاية
واجهه المستخدم. النسخة الأصلية موصوفة في Bonfield، JK، Smith، KF and Staden، R. أ
برنامج تجميع تسلسل الحمض النووي الجديد. الدقة الأحماض النووية. 24 ، 4992-4999 (1995)
Gap5 كبير جدًا وقوي. يستخدم الجميع مجموعة فرعية من الخيارات ولديهم
الطريقة المفضلة للوصول إليها واستخدامها. على الرغم من وجود الكثير منه ، إلا أن المستخدمين كذلك
تم تشجيعهم على مراجعة كل الوثائق مرة واحدة ، فقط لاكتشاف ما هو
ممكن ، والطريقة التي تناسب عملهم على أفضل وجه. على الأقل ، كل هذا
يجب قراءة الفصل التمهيدي ، لأنه على المدى الطويل ، سيوفر الوقت.
OPTIONS
-ر للقراءة فقط
- ماكس N
الحد الأقصى لطول الإجماع الإجمالي الأولي
-ماكسدب N
العدد الأقصى الأولي من contigs + قراءات
-(لا الاختيار
(لا) تشغل فحص قاعدة البيانات عند فتح قاعدة البيانات
- (no_) exec_notes
(لا) تنفذ ملاحظات OPEN / CLOS عند فتح قاعدة البيانات
- (no_) rawdata_note
(لا) تستخدم ملاحظة RAWD بدلاً من RAWDATA env. عامل
- (no_) csel
(لا) تبدأ تشغيل محدد contig عند فتح db
-عرض
X عرض للاستخدام
-حجم N
يحدد حجم ملف aux لقواعد البيانات الجديدة (32/64)
-مزامنة استخدام الوضع المتزامن لعرض الخادم (تصحيح)
-- قائمة نهاية الجدل
استخدم gap5 عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
