هذا هو الأمر masai_output_pe الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
masai_output_pe - إخراج Masai - وضع النهاية المقترن
موجز
masai_output_pe [الخيارات]
الوصف
Masai هو مخطط قراءة سريع ودقيق يعتمد على بذور تقريبية ومتعددة
التراجع.
يرى http://www.seqan.de/projects/masai للمزيد من المعلومات.
(ج) حقوق الطبع والنشر 2011-2012 بواسطة Enrico Siragusa.
-h, --مساعدة
يعرض رسالة المساعدة هذه.
--الإصدار
عرض معلومات الإصدار
خيارات الاقتران:
-ng, - لا فجوات
لا تحاذي القراءات مع الفجوات.
-ل, - طول المكتبة NUM
طول المكتبة. الافتراضي: 220.
-The, - خطأ في المكتبة NUM
تفاوت طول المكتبة. الافتراضي: 50.
خيارات الإخراج:
-t, - مجلد tmp STR
حدد مجلدًا مؤقتًا ضخمًا. الافتراضي: استخدم مجلد الجينوم.
-o, --ملف إلاخراج FILE
حدد ملف الإخراج. الافتراضي: استخدم بادئة اسم الملف reads. أنواع الملفات الصالحة
هي: خام وسام.
-NC, - لا سيجار
لا تقم بإخراج سلسلة CIGAR. هذا يؤثر فقط على إخراج SAM.
خيارات التصحيح:
-اختصار الثاني, --لا تفريغ
لا تفريغ النتائج.
VERSION
إصدار masai_output_pe: 0.7.1 [14053] آخر تحديث 2013-05-16
استخدم masai_output_pe عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
