هذا هو الأمر psi3 الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
psi3 - برنامج تشغيل تنفيذي رئيسي لبرامج PSI
الوصف
البرنامج رطل لكل بوصة مربعة 3 يقرأ مجموعة المدخلات الخاصة بك ، ويحدد نوع الحساب الذي تحاول
لأداء وتشغيل البرامج المناسبة. رطل لكل بوصة مربعة 3 يقرأ الملف
/usr/local/psi3/share/psi.dat افتراضيًا. يحتوي هذا الملف على وحدات ماكرو لبعض المعايير
العمليات الحسابية. Psi مرن للغاية ، ومع ذلك ، يمكن أن يكون أي شيء في ملف psi.dat
تجاوزها المستخدم. وبالتالي ، يجب أن يؤخذ كل ما هو مكتوب أدناه بحبوب
ملح. التجريب هو أفضل طريقة لتعلم رطل لكل بوصة مربعة 3 الأمر ، ولا شيء هذا
المكتوب هنا يجب أن يؤخذ على أنه إنجيل. مكان جيد للبحث عن بناء الجملة في psi.dat
ملف. نأمل أن تخبرك صفحة الرجل هذه وملف psi.dat بكل ما تحتاج إلى معرفته
للبدء.
سطر الأوامر OPTIONS
تتوفر وسيطات سطر الأوامر التالية:
-i or -f
يتم استخدام هذه العلامة لتحديد اسم ملف الإدخال ، على سبيل المثال رطل لكل بوصة مربعة 3 -i h2o.in أين h2o.in
هو اسم ملف الإدخال. بشكل افتراضي، رطل لكل بوصة مربعة 3 وستظهر وحدات PSI التي تستدعيها
لـ المدخلات .
-o تستخدم هذه العلامة لتحديد اسم ملف الإخراج ، على سبيل المثال رطل لكل بوصة مربعة 3 -o h2o.out أين
h2o.in هو اسم ملف الإخراج. بشكل افتراضي، رطل لكل بوصة مربعة 3 ووحدات PSI التي تستدعيها
سيبحث عنه الإخراج .
-p تستخدم هذه العلامة لتحديد بادئة ملف PSI ، على سبيل المثال رطل لكل بوصة مربعة 3 -p h2o.dzp أين
h2o.dzp هي البادئة التي سيتم استخدامها لجميع ملفات PSI. بشكل افتراضي، رطل لكل بوصة مربعة 3 و PSI
الوحدات التي تستدعيها ستستخدم PSI لبادئة الملف. ومن ثم ، ملف نقاط التفتيش
بشكل افتراضي يسمى psi.32 .
--أي إدخال or -n
هذا يقول رطل لكل بوصة مربعة 3 سائق لا يركض إدخال برنامج. هذه العلامة مفيدة للبرمجة
والتصحيح.
--التحقق من or -c
هذا يقول رطل لكل بوصة مربعة 3 سائق للتحقق من الإدخال وطباعة قائمة البرامج التي
سيتم إعدامه. أي ما يعادل الإعداد تحقق = صحيح في ملف الإدخال.
--فوضوي or -m
هذا يقول رطل لكل بوصة مربعة 3 سائق عدم تشغيل برنامج التنظيف نفسية . عادة ، التنظيف
يتم استدعاء البرنامج عبر $ تم الماكرو المحدد في psi.dat . هذا العلم مفيد
للبرمجة والتصحيح.
INPUT FORMAT
ال رطل لكل بوصة مربعة 3 يبحث البرنامج من خلال مسار الكلمات الرئيسية الافتراضي (أولاً PSI وثم DEFAULT)
للكلمات الرئيسية التالية:
نوع الوظيفة = سلسلة
هذا يخبر رطل لكل بوصة مربعة 3 برنامج السائق ما نوع الحساب الذي تريد تشغيله.
الخيارات المقبولة هي: SP (لحساب الطاقة من نقطة واحدة) ، الأراضي الفلسطينية المحتلة (ل
التحسين ، إما باستخدام التدرجات أو الطاقات) ، FREQ (للاهتزاز التوافقي
الترددات) ، FC (لثوابت القوة بالاختلافات المحدودة في الإحداثيات الداخلية
), SYMM_FC (لثوابت القوة بالاختلافات المحدودة في الإحداثيات الداخلية ،
الأوضاع المتماثلة فقط) ، DISP (لسلسلة من النقاط المفردة عند مختلف النازحين
الهندسة) ، DBOC (لحساب تصحيح بورن-أوبنهايمر القطري [DBOC] إلى
الطاقة الإلكترونية). الافتراضي هو SP.
WFN = سلسلة
هذا هو نوع الدالة الموجية المطلوبة في النهاية. حتى كتابة هذه السطور ،
القيم المقبولة لـ WFN هي SCF و MP2 و CCSD و CCSD_T و DETCI و CASSCF و RASSCF.
إن تعريف WFN بأنه أي شيء آخر ليس بالضرورة أمرًا سيئًا ، لكن لا تتوقعه رطل لكل بوصة مربعة 3
لتكون قادرًا على معرفة ما يجب القيام به. إذا كان لديك WFN غير قياسي ، فسيكون كذلك
ربما يكون من الأفضل توفير قسم EXEC (انظر أدناه). لا يوجد تقصير.
REFERENCE = سلسلة
هذا يحدد دالة الموجة المرجعية المطلوبة. يمكن أن تكون واحدة من RHF (ل
قذيفة مغلقة مقيدة بالدوران Hartree-Fock) ، روهف (لغطاء مفتوح مقيد بالدوران
Hartree-Fock) ، UHF (بالنسبة إلى Hartree-Fock ذو القشرة المفتوحة غير المقيد) ، أو توكون
(لقمتين للتكوين). الافتراضي هو RHF.
نوع ديرتيب = سلسلة
هذا يحدد ترتيب المشتق الذي يجب القيام به في النهاية. الافتراضي
is لا شيء.
الأراضي الفلسطينية المحتلة = منطقية
اضبط هذا على يساوي صحيحًا إذا كنت تقوم بإجراء تحسين هندسي. الافتراضي
هو زائف. ملاحظة: هذه كلمة رئيسية قديمة عفا عليها الزمن الآن ؛ تم استبداله
عن طريق نوع الوظيفة الكلمة.
NOPT = عدد صحيح
هذا يعطي الحد الأقصى لعدد التكرارات إذا كانت OPT صحيحة. الافتراضي هو 1.
DISP = منطقية
اضبط هذا على يساوي صحيحًا إذا كنت تقوم بإجراء عمليات نزوح محدودة. الافتراضي
هو زائف. ملاحظة: هذه كلمة رئيسية قديمة عفا عليها الزمن الآن ؛ تم استبداله
عن طريق نوع الوظيفة الكلمة.
NDISP = عدد صحيح
هذا يعطي الحد الأقصى لعدد حالات النزوح إذا كان DISP صحيحًا. الافتراضي هو 1.
نكاسيتر = عدد صحيح
هذا يعطي الحد الأقصى لعدد تكرارات CASSCF إذا كانت WFN = CASSCF. الافتراضي هو
1.
التحقق = منطقية
إذا كان هذا صحيحًا ، إذن رطل لكل بوصة مربعة 3 سيحلل سطح الإدخال الخاص بك ، ويطبع التسلسل
من الأوامر ليتم تنفيذها. الافتراضي هو خطأ.
EXEC = سلسلة_نقل
يحتوي ناقل EXEC على قائمة بالأوامر التي سيتم تنفيذها بواسطة رطل لكل بوصة مربعة 3. صريح
يمكن إدخال الأوامر في علامات اقتباس مزدوجة ، أو يمكن إدخال متغيرات محددة مسبقًا باستخدام
الاتفاقية $متغير (انظر الأمثلة أدناه). وبالتالي إذا كنت تريد الركض أحبار at
نقطة ما ، يمكن أن يكون لديك
رطل لكل بوصة مربعة: (
تنفيذي = (
"ints"
)
)
or
رطل لكل بوصة مربعة: (
ints = "ints"
تنفيذي = (
ints دولار
)
)
في مدخلاتك.
عقدة مراقبة
تتم معالجة التحكم في الحلقة عبر الأمرين المدمجين "التكرار" و "الإنهاء". الصيغة هي
كرر n [أوامر ليتم تنفيذها] النهاية
أين n هو عدد مرات تكرار الحلقة. سوف يتم فحص ملف psi.dat
تبين أن هذه هي الطريقة التي يتم بها تنفيذ التحسينات الهندسية وعمليات الإزاحة المحدودة ؛ في
هذه الحالات n تم تعيينه على قدم المساواة مع NOPT أو NDISP.
أمثلة
لنفترض أنك تريد إجراء تحسين هندسة scf. لك رطل لكل بوصة مربعة 3 يمكن أن يكون الإدخال بعد ذلك:
تقصير: (
نوع الوظيفة = اختيار
wfn = scf
dertype = أولا
المرجع = rhf
نوبت = 5
)
ابحث عن رطل لكل بوصة مربعة 3 هذا هو البحث في psi.dat أو الإدخال الخاص بك لمتغير يسمى
SCFCLOSEDFIRSTOPT (كما ترى ، PSI تسلسل القيم (تقريبًا) لـ WFN ، REFERENCE ،
DERTYPE ، و OPT / DISP ، بهذا الترتيب تقريبًا (لا تهم الحالة)) ، ثم
ينفذ الأوامر المحددة في ناقل SCFCLOSEDFIRSTOPT. فهمتها؟
والآن ، لنفترض أنك تريد تشغيل برنامج "myscf" بدلاً من أي برنامج scf رطل لكل بوصة مربعة 3 يعتقد
يجب عليك الركض. ما ستفعله هو وضع الخط
scf = "myscf"
في مدخلاتك.
حسنًا ، مثال أخير ، إذن أنت وحدك. أريد أن تشغيل لائق بعد مشتق في بلدي
التدرج scf. سيكون لدي عدة طرق للقيام بذلك.
1) القوة الغاشمة
تقصير: (
تنفيذي = (
كرر 5
"سنتات"
"CSCF"
$ deriv٪ هذا معرّف في psi.dat على أنه "cints --deriv1"
"oeprop"
$ geomupdate٪ هذا معرف في psi.dat
النهاية
$ تم
)
)
2) أنيق
تقصير: (
SCFFirst = ($ ints $ scf $ deriv $ oeprop)
)
3) غامض
تقصير: (
مشتق = ("cints --deriv1" "oeprop")
)
وهناك آخرون. الحد الوحيد هو خيالك المعذب.
كما قلت ، أفضل طريقة لمعرفة ماذا رطل لكل بوصة مربعة 3 يمكن القيام به هو البحث في psi.dat واللعب
حول لفترة. يعد خيار التحقق مفيدًا جدًا لهذا الغرض. حظ سعيد!
25 أغسطس، 2003 رطل لكل بوصة مربعة 3(1)
استخدم psi3 عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
