هذا هو تطبيق Linux المسمى locusvu الذي سيتم تشغيله في Linux عبر الإنترنت والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم LocusVu.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل هذا التطبيق المسمى locusvu وتشغيله عبر الإنترنت للتشغيل في Linux عبر الإنترنت باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
locusvu للتشغيل في Linux عبر الإنترنت
الوصف
LocusVu هي أداة برمجية جديدة تعتمد على Java والتي تقبل قائمة المواقع الجينومية (المواضع على الكروموسوم) كمدخلات وتقوم بأتمتة عملية جلب المعلومات ذات الصلة (النطاق الخلوي، اسم الجين، بيانات OMIM وما إلى ذلك) من قواعد البيانات العامة مثل متصفح الجينوم UCSC قاعدة البيانات. ثم يقوم بعد ذلك بتمكين مسارات عمل متعددة على النتائج المستردة، مثل مقارنة مجموعات بيانات متعددة (علم الجينوم المقارن)، أو عرض الجينات المجاورة لأحد المواقع من داخل الأداة نفسها، أو تمثيل هذه النتائج بيانيًا في مخططات شريطية/دائرية. يحتوي LocusVu على واجهة مستخدم رسومية بسيطة وسهلة الاستخدام على الواجهة الأمامية والتي تتيح تفاعل المستخدم البديهي مع المنطق الأساسي.يمكن توسيع الأداة بسهولة لإضافة دعم لقواعد البيانات الأخرى (مثل Ensembl) أو لجلب المعلومات
من الجداول الأخرى في قاعدة البيانات. وبالتالي، يوفر LocusVu إطارًا أساسيًا يمكن استخدامه من قبل المستخدمين والمطورين على حدٍ سواء لتبسيط سير العمل الحالي وإنشاء مسارات جديدة لدعم تحليل البيانات في علم الجينوم.
المميزات
- أتمتة عملية استرجاع البيانات من قواعد البيانات (قاعدة بيانات متصفح الجينوم UCSC حاليًا)
- تمكين سير العمل على النتائج المستردة مثل..
- مقارنة مجموعات بيانات متعددة (علم الجينوم المقارن)
- ..عرض الجينات المجاورة للمكان (من داخل الأداة نفسها)
- .. تمثيل النتائج بيانياً (المخططات الشريطية / الدائرية)
- واجهة المستخدم الرسومية سهلة الاستخدام على الواجهة الأمامية للاستخدام البديهي
- التسجيل باستخدام Log4j لسهولة التصحيح
- قابل للتوسيع بسهولة
الجمهور
العلوم / البحث والمطورين
واجهة المستخدم
تأرجح جافا
لغة البرمجة
جافا
بيئة قاعدة البيانات
MySQL
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/locusvu/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.
