هذا هو تطبيق Linux المسمى MSL للتشغيل في Linux عبر الإنترنت والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ mslib-1.1.0.9.tgz. ويمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل هذا التطبيق المسمى MSL وتشغيله عبر الإنترنت للتشغيل في Linux عبر الإنترنت باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
MSL للتشغيل في Linux عبر الإنترنت
Ad
الوصف
MSL هي مكتبة C ++ تتيح الدراسة الحسابية للجزيئات الكبيرة.مكتبة MSL ليست برنامجًا (على الرغم من توزيع بعض التطبيقات) ولكنها أداة للعالم لتشفير طرق النمذجة الجزيئية الخاصة بهم.
فلسفة
الهدف الرئيسي هو إنشاء مجموعة من الأدوات التي تمكن من الدراسة الحسابية للجزيئات الكبيرة بسهولة نسبية على جميع المستويات ، من العمليات البسيطة (على سبيل المثال ، تحميل PDB وقياس المسافة أو تحرير ثنائي السطوح) إلى التطبيقات المعقدة (نمذجة البروتين أو التصميم).
تم تطوير MSL في مختبر Senes بجامعة Wisconsin-Madison وبواسطة فريق من المطورين / المستخدمين من مختبرات بحثية أخرى.
مرجع:
كولب دي دبليو ، سوبرامانيام إس ، دونالد جي إي ، هانيجان بي تي ، مولر بي كيه ، غريغوريان جي ، سينيس أ.
المعلوماتية الهيكلية والنمذجة والتصميم مع مكتبة البرمجيات الجزيئية مفتوحة المصدر (MSL).
J كمبوت تشيم. 2012 المجلد. 33 صفحة 1645-61
تنزيل المقال من http://dx.doi.org/10.1002/jcc.22968
شرح المميزات:
- القدرة على التخزين والتبديل بين إحداثيات ذرات متعددة ، من أجل التغييرات التوافقية والتمثيل الدوراني للحرية المطابقة للسلسلة الجانبية.
- القدرة على بناء وتخزين هويات متعددة للمخلفات (مثل LEU ، ILE ، ALA) في موضع والتبديل بينها.
- # مجال قوة CHARMM ووظائف الطاقة الأخرى.
- التحولات مثل الترجمات والتناوب والمحاذاة.
- خوارزميات البحث مثل Monte Carlo و Dead End Elimination و Self Consistent Mean Field Monte Carlo. ، وأخذ العينات من العمود الفقري
- جيل كريستال شعرية.
- دعم مكتبات الروتامر
- تعديل وتوليد العمود الفقري
- المنصات المدعومة: Linux و MacOS
الجمهور
بحث علمي
لغة البرمجة
C + +
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/mslib/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.