هذا هو تطبيق Linux المسمى SuRankCo الذي سيتم تشغيله في Linux عبر الإنترنت والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم surankco_r5.tar.gz. ويمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل هذا التطبيق المسمى SuRankCo وتشغيله عبر الإنترنت للتشغيل في Linux عبر الإنترنت باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SuRankCo للتشغيل في Linux عبر الإنترنت
Ad
الوصف
SuRankCo هو برنامج قائم على التعلم الآلي لتسجيل وتصنيف contigs من تجميعات جديدة لبيانات تسلسل الجيل التالي. إنه يتدرب مع محاذاة contigs مع الجينومات المرجعية المعروفة ويتنبأ بالنتائج وترتيب contigs التي ليس لها جينوم مرجعي ذي صلة حتى الآن.لمزيد من التفاصيل حول SuRankCo وعملها، يرجى الاطلاع على
"SuRankCo: الترتيب الخاضع للإشراف لـ Contigs في التجميعات الجديدة"
ماتياس كوهرينغ، وبيوتر فويتيك دابروفسكي، وأندرياس نيتشه، وبيرنهارد ي. رينارد
(http://www.biomedcentral.com/1471-2105/16/240/abstract)
يرجى ملاحظة أنه يوصى بقراءة الورقة وملف readme.txt قبل استخدام SuRankCo.
تحديث يونيو 2015:
* تغييرات طفيفة لتمكين دعم BAM.
تحديث فبراير 2014:
* تمت إضافة الدعم لتجميعات FASTA/SAM بالإضافة إلى ACE/FASTQ(QUAL).
ملاحظة: لا تتضمن ميزات تجميعات FASTA/SAM BaseCount وBaseSeqmentCount وContigQualities حتى الآن.
الجمهور
بحث علمي
واجهة المستخدم
سطر الأوامر
لغة البرمجة
جافا ، S / R
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/surankco/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.
