জৈব রংধনু - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

রংধনু - রংধনুর জন্য ম্যানুয়াল পৃষ্ঠা 2.0.4 --[ইমেল সুরক্ষিত], [ইমেল সুরক্ষিত]>

সাইনোপিসিস

রামধনু [অপশন]

বর্ণনাঃ

রংধনু 2.0.4 -- <[ইমেল সুরক্ষিত], [ইমেল সুরক্ষিত]>

গুচ্ছ

ইনপুট ফাইল ফরম্যাট: পেয়ার করা ফাস্টা/ফাস্টকিউ ফাইল(গুলি) আউটপুট ফাইল ফরম্যাট:
\t \t \t

-1 ইনপুট fasta/fastq ফাইল, একাধিক '-1' সমর্থন করে

-2 ইনপুট fasta/fastq ফাইল, একাধিক '-2' সমর্থন করে [নাল]

-l
দৈর্ঘ্য পড়ুন, ডিফল্ট: 0 পরিবর্তনশীল

-m
সর্বাধিক অমিল [4]

-e
সঠিকভাবে মেলে থ্রেশহোল্ড [2000]

-L পলিমারফিজমের নিম্ন স্তর

dIV আছে

ইনপুট ফাইল বিন্যাস: \t \t \t আউটপুট
ফাইলের বিন্যাস:
\t \t \t [\t ]

-i ইনপুট ফাইল [stdin]

-o আউটপুট ফাইল [stdout]

-k
K_allele, একটি নতুন গ্রুপ তৈরি করার জন্য ন্যূনতম ভেরিয়েন্ট [2]

-K
K_allele, কম্পাঙ্ক নির্বিশেষে ভাগ করুন যখন বৈকল্পিক সংখ্যা এই মান অতিক্রম করে
[50]

-f
ফ্রিকোয়েন্সি, একটি নতুন গ্রুপ তৈরি করার জন্য সর্বনিম্ন বৈকল্পিক ফ্রিকোয়েন্সি [0.2]

মার্জ

ইনপুট ফাইল বিন্যাস:
\t \t \t [\t ]

-i ইনপুট rbasm আউটপুট ফাইল [stdin]

-a আউটপুট সমাবেশ

-o মার্জড কনটিগের জন্য আউটপুট ফাইল, প্রতি ক্লাস্টারে একটি লাইন [stdout]

-N
একত্রিত করার জন্য বিভক্ত ক্লাস্টারের সর্বাধিক সংখ্যা [300]

-l
দুটি রিড একত্রিত করার সময় ন্যূনতম ওভারল্যাপ ('-a' খোলা হলেই বৈধ) [5]

-f
সমাবেশের সময় মিলের ন্যূনতম ভগ্নাংশ ('-a' খোলা হলেই বৈধ)
[0.90]

-r
একত্রিত করার জন্য ন্যূনতম সংখ্যক পাঠ (শুধুমাত্র '-a' খোলা হলে বৈধ) [5]

-R
একত্রিত করার জন্য সর্বাধিক সংখ্যক পাঠ্য ('-a' খোলা হলেই বৈধ) [৩০০]

ব্যবহার: রংধনু [বিকল্প]

গুচ্ছ

ইনপুট ফাইল ফরম্যাট: পেয়ার করা ফাস্টা/ফাস্টকিউ ফাইল(গুলি) আউটপুট ফাইল ফরম্যাট:
\t \t \t

-1 ইনপুট fasta/fastq ফাইল, একাধিক '-1' সমর্থন করে

-2 ইনপুট fasta/fastq ফাইল, একাধিক '-2' সমর্থন করে [নাল]

-l
দৈর্ঘ্য পড়ুন, ডিফল্ট: 0 পরিবর্তনশীল

-m
সর্বাধিক অমিল [4]

-e
সঠিকভাবে মেলে থ্রেশহোল্ড [2000]

-L পলিমারফিজমের নিম্ন স্তর

dIV আছে

ইনপুট ফাইল বিন্যাস: \t \t \t আউটপুট
ফাইলের বিন্যাস:
\t \t \t [\t ]

-i ইনপুট ফাইল [stdin]

-o আউটপুট ফাইল [stdout]

-k
K_allele, একটি নতুন গ্রুপ তৈরি করার জন্য ন্যূনতম ভেরিয়েন্ট [2]

-K
K_allele, কম্পাঙ্ক নির্বিশেষে ভাগ করুন যখন বৈকল্পিক সংখ্যা এই মান অতিক্রম করে
[50]

-f
ফ্রিকোয়েন্সি, একটি নতুন গ্রুপ তৈরি করার জন্য সর্বনিম্ন বৈকল্পিক ফ্রিকোয়েন্সি [0.2]

মার্জ

ইনপুট ফাইল বিন্যাস:
\t \t \t [\t ]

-i ইনপুট rbasm আউটপুট ফাইল [stdin]

-a আউটপুট সমাবেশ

-o মার্জড কনটিগের জন্য আউটপুট ফাইল, প্রতি ক্লাস্টারে একটি লাইন [stdout]

-N
একত্রিত করার জন্য বিভক্ত ক্লাস্টারের সর্বাধিক সংখ্যা [300]

-l
দুটি রিড একত্রিত করার সময় ন্যূনতম ওভারল্যাপ ('-a' খোলা হলেই বৈধ) [5]

-f
সমাবেশের সময় মিলের ন্যূনতম ভগ্নাংশ ('-a' খোলা হলেই বৈধ)
[0.90]

-r
একত্রিত করার জন্য ন্যূনতম সংখ্যক পাঠ (শুধুমাত্র '-a' খোলা হলে বৈধ) [5]

-R
একত্রিত করার জন্য সর্বাধিক সংখ্যক পাঠ্য ('-a' খোলা হলেই বৈধ) [৩০০]

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে বায়ো-রেইনবো ব্যবহার করুন