এটি bowtie2-build-s কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
bowtie2-build-s - bowtie2 এর জন্য একটি কালারস্পেস সূচক তৈরি করা
সাইনোপিসিস
bowtie2-build-s [অপশন]*
বর্ণনাঃ
বেন ল্যাংমেড দ্বারা বোটি 2 সংস্করণ 2.2.6 ([ইমেল সুরক্ষিত], www.cs.jhu.edu/~langmea)
রেফারেন্স_ইন
রেফ সিকোয়েন্স সহ ফাইলগুলির কমা দ্বারা পৃথক করা তালিকা
bt2_index_base
এই dir/basename দিয়ে ফাইলগুলিতে bt2 ডেটা লিখুন
*** Bowtie 2 সূচী শুধুমাত্র v2 এর সাথে কাজ করে (v1 নয়)। একইভাবে v1 সূচকের জন্য। ***
বিকল্প
-f রেফারেন্স ফাইল ফাস্তা (ডিফল্ট)
-c cmd লাইনে প্রদত্ত রেফারেন্স ক্রম (যেমন )
-a/---নোয়াটো
স্বয়ংক্রিয় নিষ্ক্রিয় করুন -p/--bmax/--dcv মেমরি-ফিটিং
-p/---প্যাকড
অভ্যন্তরীণভাবে প্যাক করা স্ট্রিং ব্যবহার করুন; ধীর, কম স্মৃতি
--বিম্যাক্স
ব্লকওয়াইজ প্রত্যয়-অ্যারে নির্মাতার জন্য max bucket sz
--bmaxdivn
রেফ লেনের বিভাজক হিসাবে সর্বাধিক বালতি এসজেড (ডিফল্ট: 4)
--dcv
ব্লকওয়াইজের জন্য ডিফ-কভার পিরিয়ড (ডিফল্ট: 1024)
--nodc ডিফ-কভার অক্ষম করুন (অ্যালগরিদম চতুর্মুখী হয়ে যায়)
-r/---নোরেফ
.3/.4 সূচক ফাইল তৈরি করবেন না
-3/---justref
শুধু .3/.4 ইনডেক্স ফাইল তৈরি করুন
-o/---অফরেট
SA প্রতি 2^ নমুনা করা হয় BWT অক্ষর (ডিফল্ট: 5)
-t/---ফতাবচার
প্রারম্ভিক লুকআপে ব্যবহৃত অক্ষরের #টি (ডিফল্ট: 10)
--বীজ
র্যান্ডম নম্বর জেনারেটরের জন্য বীজ
-q/--- শান্ত
ভার্বোস আউটপুট (ডিবাগিংয়ের জন্য)
-h/--- সাহায্য
টুল এবং এর বিকল্পগুলির বিস্তারিত বিবরণ মুদ্রণ করুন
-- ব্যবহার
এই ব্যবহার বার্তা প্রিন্ট করুন
--সংস্করণ
প্রিন্ট সংস্করণ তথ্য এবং প্রস্থান
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে bowtie2-build-s অনলাইন ব্যবহার করুন
