āĻāĻāĻŋ āĻšāĻ˛ bp_run_neighbor.plp āĻāĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄ āĻ¯āĻž āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻāĻ¸ā§āĻā§āĻļāĻ¨ āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨ āĻāĻŦā§āĻ¨ā§āĻā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻĢā§āĻĄā§āĻ°āĻž āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻāĻāĻ¨ā§āĻĄā§āĻ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦāĻž MAC OS āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ OnWorks āĻĢā§āĻ°āĻŋ āĻšā§āĻ¸ā§āĻāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¤ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§ āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤
āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¯āĻā§āĻ°āĻŽ:
NAME āĻāĻ°
run_neighbour - Bioperl āĻāĻ° āĻŽāĻžāĻ§ā§āĻ¯āĻŽā§ āĻĢāĻŋāĻ˛āĻŋāĻĒā§āĻ° 'āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻŦā§āĻļā§' āĻĒā§āĻ°ā§āĻā§āĻ°āĻžāĻŽ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨
āĻ¸āĻžāĻāĻ¨ā§āĻĒāĻŋāĻ¸āĻŋāĻ¸
run_neighbour [-i inputfile] [-o outfilename]
āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻžāĻ
āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻŦā§āĻļā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻāĻŋ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻ°āĻŋāĻā§āĻ¸ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨ āĻāĻ°ā§āĻ¨āĨ¤ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§āĻ° āĻ¨āĻžāĻŽ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§āĻ° āĻĢāĻ°ā§āĻŽāĻž āĻšāĻ¤ā§ āĻšāĻŦā§
āĻŦāĻž file.protdist (āĻļā§āĻˇ āĻā§āĻ¨ āĻŦā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻžāĻ° āĻ¨āĻž, āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻ¤ā§ āĻĒā§āĻ°ā§āĻā§āĻ°āĻžāĻŽ āĻāĻāĻžāĻ°ā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻāĻļāĻž āĻāĻ°ā§
(\S+)\.(\S+)āĨ¤
āĻāĻāĻŋ āĻāĻāĻāĻŋ āĻĒā§āĻ°ā§āĻāĻŋāĻ¨ āĻĨā§āĻā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻŦā§āĻļā§-āĻ¯ā§āĻāĻĻāĻžāĻ¨āĻāĻžāĻ°ā§ āĻāĻžāĻ āĻ¤ā§āĻ°āĻŋ āĻāĻ°āĻ¤ā§ 'āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻŦā§āĻļā§' āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻŦā§
āĻĻā§āĻ°āĻ¤ā§āĻŦ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻ°āĻŋāĻā§āĻ¸āĨ¤
onworks.net āĻĒāĻ°āĻŋāĻˇā§āĻŦāĻž āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ bp_run_neighbor.plp āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§āĻ¨