এটি হল bp_run_protdist.plp কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
run_neighbour - Bioperl এর মাধ্যমে Phylip এর 'protdist' প্রোগ্রাম চালান
সাইনোপিসিস
run_protdist [-i inputfile] [-o outfilename]
বর্ণনাঃ
protdist চালু করার জন্য একটি প্রান্তিককরণ ফাইল প্রদান করুন। ফাইলের নাম .aln বা .phy হতে হবে।
এটি প্রয়োজন যাতে আমরা নির্ধারণ করতে পারি যে আমাদের একটি ক্লাস্টল অ্যালাইনমেন্টকে রূপান্তর করতে হবে কিনা
ফিলিপ অন্যান্য MSA ফরম্যাটে কাজ করার জন্য স্ক্রিপ্ট প্রসারিত করার জন্য আপনাকে স্বাগত জানাই যা bioperl
সমর্থন করে এটি খুব সাধারণ ম্যানুয়াল পাইপলাইনে ব্যবহার করার উদ্দেশ্যে করা হয়েছে।
ইনপুট ফাইলের নাম করা উচিত file.phy বা file.aln আকারে প্রোগ্রামটি আশা করে a
(\S+)\.(\S+) আকারে ফাইল।
এটি এএ প্রোটিন তৈরি করতে 'কিমুরা' সূত্র ব্যবহার করে 'প্রোটডিস্ট' অ্যাপ্লিকেশন চালাবে
দূরত্ব ম্যাট্রিক্স। যাদের phylip3.6 আছে তারা ব্যবহার করতে চাইলে কিছু পরিবর্তন করতে চাইবে
জেটিটি। অনুরোধ করা হলে এটিকে cmd-লাইন আর্গুমেন্ট হিসেবে যোগ করতে সাহায্য করতে পেরে আমি খুশি।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে bp_run_protdist.plp ব্যবহার করুন
