ডেল্টা-ফিল্টার - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

ডেল্টা-ফিল্টার - নিউমার বা প্রমার থেকে একটি ডেল্টা অ্যালাইনমেন্ট ফাইল পড়ুন এবং ফিল্টার করুন
প্রান্তিককরণ

সাইনোপিসিস

ডেল্টা-ফিল্টার [বিকল্প]

বর্ণনাঃ

-1 1-থেকে-1 প্রান্তিককরণ পুনর্বিন্যাস করার অনুমতি দেয় (এর ছেদ -r এবং -q প্রান্তিককরণ)

-g 1-থেকে-1 বিশ্বব্যাপী প্রান্তিককরণ পুনর্বিন্যাস করার অনুমতি দেয় না

-h সাহায্য তথ্য প্রদর্শন করুন

-i ভাসা
ন্যূনতম প্রান্তিককরণ পরিচয় সেট করুন [0, 100], ডিফল্ট 0

-l int সর্বনিম্ন প্রান্তিককরণ দৈর্ঘ্য সেট করুন, ডিফল্ট 0

-m বহু-থেকে-অনেক প্রান্তিককরণ পুনর্বিন্যাস করার অনুমতি দেয় (এর ইউনিয়ন -r এবং -q প্রান্তিককরণ)

-q প্রতিটি প্রশ্নের প্রতিটি অবস্থানকে রেফারেন্সে তার সেরা হিটের জন্য ম্যাপ করে, অনুমতি দেয়
রেফারেন্স ওভারল্যাপ

-r প্রতিটি রেফারেন্সের প্রতিটি অবস্থানকে ম্যাপ করে ক্যোয়ারীতে তার সেরা হিটের জন্য, অনুমতি দেয়
প্রশ্ন ওভারল্যাপ

-u float সর্বনিম্ন প্রান্তিককরণ স্বতন্ত্রতা সেট করুন, অর্থাৎ শতাংশের

অনন্য রেফারেন্স এবং ক্যোয়ারী ক্রম [0, 100], ডিফল্ট 0 এর সাথে মিলিত প্রান্তিককরণ

-o ভাসা
জন্য সর্বোচ্চ প্রান্তিককরণ ওভারল্যাপ সেট করুন -r এবং -q একটি শতাংশ হিসাবে বিকল্প
প্রান্তিককরণ দৈর্ঘ্য [0, 100], ডিফল্ট 100

-v যেগুলি ফিল্টারগুলি পাস করে তার পরিবর্তে বাতিল করা প্রান্তিককরণগুলি প্রিন্ট করুন৷

-b মানচিত্রের অনুলিপি (এর XOR -r এবং -q প্রান্তিককরণ, এক বা অন্য কিন্তু উভয় নয়)

নিউমার বা প্রমার থেকে একটি ডেল্টা অ্যালাইনমেন্ট ফাইল পড়ে এবং সারিবদ্ধকরণ ভিত্তিক ফিল্টার করে
কমান্ড-লাইন সুইচগুলিতে, শুধুমাত্র কাঙ্খিত প্রান্তিককরণগুলি রেখে যা আউটপুট হয়
ইনপুট হিসাবে একই ডেল্টা বিন্যাসে stdout. একাধিক সুইচের জন্য, অপারেশনের ক্রম
নিম্নরূপ: -i -l -u -q -r -g -m -1 -b. যদি একটি প্রান্তিককরণ একটি পূর্ববর্তী দ্বারা বাদ দেওয়া হয়
অপারেশন, এটি সফল অপারেশন দ্বারা উপেক্ষা করা হবে.

মধ্যে একটি গুরুত্বপূর্ণ পার্থক্য -g বিকল্প এবং -1 এবং -m অপশন হল যে -g
সারিবদ্ধকরণগুলি তাদের ক্রমে পারস্পরিকভাবে সামঞ্জস্যপূর্ণ হওয়া প্রয়োজন, যখন -1 এবং -m
বিকল্পগুলি পারস্পরিকভাবে সামঞ্জস্যপূর্ণ হতে হবে না এবং তাই স্থানান্তর সহ্য করতে হবে,
বিপরীত, ইত্যাদি সাধারণ ক্ষেত্রে, -m বিকল্পটি সেরা পছন্দ, যাইহোক -1 হতে পারে
SNP ফাইন্ডিং এর মত অ্যাপ্লিকেশনের জন্য সহজ যার জন্য 1-থেকে-1 ম্যাপিং প্রয়োজন। অবশেষে, জন্য
ম্যাপিং ক্যোয়ারী কনটিগস, বা সিকোয়েন্সিং রিডস, একটি রেফারেন্স জিনোম ব্যবহার করুন -q. দ্য
সঙ্গে মুদ্রিত ডুপ্লিকেশন -b বিকল্প হয় -r এবং -q সারিবদ্ধকরণ যা উপস্থিত নেই
1-থেকে-1 প্রান্তিককরণ। এই প্রান্তিককরণ এছাড়াও মধ্যে পার্থক্য -1 এবং -m
প্রান্তিককরণ

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে ডেল্টা-ফিল্টার ব্যবহার করুন