ডিটেক্ট চিমেরা - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

sim4dbutils - sim4db-উত্পাদিত প্রান্তিককরণ ফাইলগুলির সাথে কাজ করার জন্য ইউটিলিটিগুলি

কনভার্টপলিশ - sim4db এবং GFF3 ফরম্যাটের মধ্যে রূপান্তর করুন
ফিল্টারপলিশ - সিকোয়েন্স আইডেন্টিটি, কভারেজ এবং দৈর্ঘ্যের উপর ভিত্তি করে ফিল্টার সারিবদ্ধকরণ।
mergePolishes - একাধিক ফাইল থেকে প্রান্তিককরণ মার্জ করুন
sortPolishes - cDNA বা জিনোমিক সিকোয়েন্স ইনডেক্স বা সিকোয়েন্সের নাম অনুসারে সারিবদ্ধকরণগুলি সাজান
convertToExtent - sim4db ফরম্যাট থেকে সিঙ্গেল-লাইন ট্যাব-ডিলিমিটেড ফরম্যাটে রূপান্তর করুন
fixPolishesIID - একটি নির্দিষ্ট ফাস্টা ফাইলের ক্রম সূচক ব্যবহার করতে একটি sim4db ফাইল আপডেট করে।
sim4db ফাইল থেকে প্রান্তিককরণের একটি উপসেট বের করতেও ব্যবহার করা যেতে পারে।
depthOfPolishes - বিভিন্ন স্থানে পলিশের গভীরতার একটি ট্যাব-সীমাবদ্ধ হিস্টোগ্রাম আউটপুট করে
জানালার মাপ।
হেডপলিশ - একটি ফাইলের প্রথম এন প্রান্তিককরণ মুদ্রণ করুন, অনুরূপ মাথা(২০১০)
pickBestPolish - প্রতিটি সিডিএনএর জন্য শুধুমাত্র 'সেরা' প্রান্তিককরণের প্রতিবেদন করুন
pickUniquePolish - সারিবদ্ধকরণের প্রতিবেদন করে যেখানে একটি স্পষ্ট একক সেরা প্রান্তিককরণ রয়েছে
প্রতিটি সিডিএনএ।
plotCoverageVsIdentity - জেনারেট করে (1) শতাংশ পরিচয়ের একটি হিস্টোগ্রাম, (2) a
শতাংশ কভারেজের হিস্টোগ্রাম, এবং (3) শতাংশ পরিচয় এবং কভারেজের একটি তালিকা (এর জন্য
একটি স্ক্যাটার প্লটে ব্যবহার করুন)।
UniqPolishes - একাধিক প্রান্তিককরণ (-uniq) সহ সিডিএনএর জন্য সমস্ত প্রান্তিককরণ ফিল্টার করে
একটি একক প্রান্তিককরণ সহ (-ডুপ্ল)। অনুরূপ, একই, সমতুল্য ইউনিক(২০১০)
realignPolishes - একটি sim4db ফাইলে তালিকাভুক্ত প্রান্তিককরণগুলি পুনরায় গণনা করুন।
রিপোর্ট অ্যালাইনমেন্ট ডিফারেন্স - একটি সেটে ত্রুটির প্রকারের একটি হিস্টোগ্রাম তৈরি করে
প্রান্তিককরণ অসমর্থিত এবং অননুমোদিত
comparePolishes - দুটি ফাইলের মধ্যে সমন্বয় সারিবদ্ধ করুন।
convertToAtac - sim4db ফরম্যাট থেকে ATAC ফরম্যাটে রূপান্তর করে।
ডিটেক্ট চিমেরা - কাইমেরিক হতে পারে এমন সিকোয়েন্সের জন্য প্রান্তিককরণ পরীক্ষা করে।
ম্যাপড কভারেজ - কোয়েরি সিকোয়েন্সের পরিমাণ রিপোর্ট করে (EST, cDNA) যা কভার করে
প্রান্তিককরণ
parseSNP - SNP-এর জন্য প্রান্তিককরণ বিশ্লেষণ করে।
রিমুভ ডুপ্লিকেট - ডুপ্লিকেট সারিবদ্ধকরণের জন্য ইনপুট অনুসন্ধান করে।
vennPolishes - একাধিক sim4db ফাইলের জন্য একটি ভেন ডায়াগ্রাম তৈরি করে। ব্যবহৃত অন্ত by
ESTMapper পরিষ্কার পোলিশ
পোলিশদের সংক্ষিপ্ত করা

বর্ণনাঃ

এই প্রোগ্রামগুলি কাজ করার জন্য ইউটিলিটিগুলির একটি পরিসর sim4db(1)-উৎপন্ন প্রান্তিককরণ ফাইল।

onworks.net পরিষেবাগুলি ব্যবহার করে অনলাইনে detectChimera ব্যবহার করুন