ডাইজেস্ট - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

ডাইজেস্ট - প্রোটিন প্রোটিওলাইটিক এনজাইম বা রিএজেন্ট ক্লিভেজ সাইটের রিপোর্ট

সাইনোপিসিস

পরিপাক করা - seqall seqall - mwdata তথ্য ফাইল -তালিকা তালিকা -মনো বুলিয়ান -অপ্রতিদ্বন্দ্বী বুলিয়ান
-র্যাগিং বুলিয়ান -টার্মিনি তালিকা -ওভারল্যাপ বুলিয়ান -সমস্ত আংশিক বুলিয়ান
-আউটফাইল রিপোর্ট

পরিপাক করা -হেল্প

বর্ণনাঃ

পরিপাক করা এটি EMBOSS এর একটি কমান্ড লাইন প্রোগ্রাম ("ইউরোপীয় আণবিক জীববিজ্ঞান ওপেন
সফটওয়্যার স্যুট"). এটি "প্রোটিন: মোটিফস" কমান্ড গ্রুপ(গুলি) এর অংশ।

বিকল্প

ইনপুট অধ্যায়
- seqall seqall

- mwdata তথ্য ফাইল
অ্যামিনো অ্যাসিডের জন্য আণবিক ওজন ডেটা ডিফল্ট মান: Emolwt.dat

প্রয়োজনীয় অধ্যায়
-তালিকা তালিকা
ডিফল্ট মান: 1

-মনো বুলিয়ান
ডিফল্ট মান: N

অগ্রসর অধ্যায়
-অপ্রতিদ্বন্দ্বী বুলিয়ান
ট্রিপসিন সাধারণত 'KR'-এর পরে কাটবে না যদি তারা 'KRIFLP'-এর যেকোনো একটি অনুসরণ করে।
Lys-C সাধারণত 'K'-এর পরে কাটবে না যদি এটি 'P'-এর পরে থাকে। আরগ-সি হবে না
সাধারণত 'R'-এর পরে কাটা হয় যদি 'P'-এর পরে থাকে। V8-bicarb সাধারণত পরে কাটা হবে না
'E' যদি এটি 'KREP'-এর যেকোনো একটি দ্বারা অনুসরণ করা হয়। V8-ফসফ সাধারণত 'DE' এর পরে কাটবে না যদি
তারা 'P' দ্বারা অনুসরণ করা হয়। কাইমোট্রিপসিন সাধারণত 'এফওয়াইডব্লিউএলএম'-এর পরে কাটবে না যদি তারা থাকে
এর পরে 'P'। প্রতিকূল উল্লেখ করা এই প্রতিকূল কাটের পাশাপাশি দেখায়
পছন্দের বেশী

-র্যাগিং বুলিয়ান
আধা-নির্দিষ্ট এবং অ-নির্দিষ্ট হজমের অনুমতি দেয়। এই বিকল্পটি বিশেষভাবে দরকারী
ব্যবহার করে প্রোটিন সনাক্তকরণের জন্য পেপটাইড সিকোয়েন্সের তালিকা তৈরি করার জন্য
ভর বর্ণালিবীক্ষণ.

-টার্মিনি তালিকা
ডিফল্ট মান: 1

আউটপুট অধ্যায়
-ওভারল্যাপ বুলিয়ান
আংশিক হজমের জন্য ব্যবহৃত হয়। পছন্দের কাট সাইট প্লাস 1..3, 2..4, থেকে সমস্ত কাট দেখায়
3..5 ইত্যাদি কিন্তু নয় (যেমন) 2..5। ওভারল্যাপগুলি তাই ঠিক একের সাথে খন্ড
এটি মধ্যে সম্ভাব্য কাটা সাইট.

-সমস্ত আংশিক বুলিয়ান
ওভারল্যাপের জন্য কিন্তু একাধিক সম্ভাব্য কাট সাইট ধারণকারী টুকরা অন্তর্ভুক্ত করা হয়।

-আউটফাইল রিপোর্ট

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইন ডাইজেস্ট ব্যবহার করুন