এটি হল ফাস্টাক-ফিল্টার কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
fastaq_filter - তাদের একটি উপসেট পেতে সিকোয়েন্স ফিল্টার করুন
বর্ণনাঃ
ব্যবহার: fastaq_filter [বিকল্প]
ক্রম দৈর্ঘ্য এবং/অথবা একটি নিয়মিত অভিব্যক্তির সাথে মিলে যাওয়া নামের দ্বারা একটি সিকোয়েন্স ফাইল ফিল্টার করে
অবস্থানগত যুক্তি:
infile ফিল্টার করা ইনপুট ফাইলের নাম
আউটফাইল
আউটপুট ফাইলের নাম
ঐচ্ছিক যুক্তি:
-h, --help
এই সাহায্য বার্তাটি দেখান এবং প্রস্থান করুন
--মিনিট_দৈর্ঘ্য INT
ক্রমানুসারের ন্যূনতম দৈর্ঘ্য [0]
--সর্বোচ্চ দৈর্ঘ্য INT
[inf] রাখার জন্য ক্রমটির সর্বাধিক দৈর্ঘ্য
--regex রিগেক্স
যদি দেওয়া হয়, শুধুমাত্র রেগুলার এক্সপ্রেশনের সাথে মিলে যাওয়া নামের সাথে রিড রাখা হবে
--ids_file ফাইল ফাইল
দেওয়া হলে, প্রদত্ত ফাইলে যাদের আইডি আছে শুধুমাত্র তারাই পড়বে। প্রতি লাইনে একটি আইডি
ফাইল.
-v, -- উল্টানো
ফিল্টারগুলির সাথে মেলে না এমন ক্রমগুলিই রাখুন৷
সঙ্গী ফাইল উন্নত পড়া জোড়া বিকল্প:
--mate_in ফাইল ফাইল
সাথীদের নাম ইনপুট ফাইল। ব্যবহার করা হলে, এছাড়াও প্রদান করতে হবে --mate_out
--mate_out ফাইল ফাইল
সঙ্গীর আউটপুট ফাইলের নাম
--উভয়_সঙ্গী_পাস
ডিফল্টরূপে, যদি mate ফিল্টার পাস করে, তাহলে উভয়ই আউটপুট পড়ে। এই পতাকা ব্যবহার করুন
একটি জোড়ার উভয় রিড ফিল্টার পাস করতে হবে
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে ফাস্টাক-ফিল্টার ব্যবহার করুন
