এটি হল ফজনুস কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
fuzznuc - নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সে প্যাটার্নের জন্য অনুসন্ধান করুন
সাইনোপিসিস
fuznuc -ক্রম seqall -প্যাটার্ন প্যাটার্ন - পরিপূরক বুলিয়ান -আউটফাইল রিপোর্ট
fuznuc -হেল্প
বর্ণনাঃ
fuznuc এটি EMBOSS এর একটি কমান্ড লাইন প্রোগ্রাম ("ইউরোপীয় আণবিক জীববিজ্ঞান ওপেন
সফটওয়্যার স্যুট"). এটি "নিউক্লিক:মোটিফস" কমান্ড গ্রুপ(গুলি) এর অংশ।
বিকল্প
ইনপুট অধ্যায়
-ক্রম seqall
-প্যাটার্ন প্যাটার্ন
নিউক্লিওটাইডগুলির জন্য আদর্শ IUPAC এক-অক্ষরের কোডগুলি ব্যবহার করা হয়। প্রতীক 'n' হয়
এমন একটি অবস্থানের জন্য ব্যবহৃত হয় যেখানে যেকোনো নিউক্লিওটাইড গ্রহণ করা হয়। অস্পষ্টতা দ্বারা নির্দেশিত হয়
বর্গাকার বন্ধনীর মধ্যে একটি প্রদত্ত অবস্থানের জন্য গ্রহণযোগ্য নিউক্লিওটাইডের তালিকা করা
]'। যেমন: [ACG] মানে A বা C বা G। অস্পষ্টতাও নির্দেশিত
এক জোড়া কোঁকড়া বন্ধনীর মধ্যে তালিকাভুক্ত করা '{ }' নিউক্লিওটাইডগুলি গ্রহণ করা হয় না
একটি নির্দিষ্ট অবস্থানে। যেমন: {AG} মানে A এবং G ছাড়া যেকোনো নিউক্লিওটাইড। প্রতিটি
একটি প্যাটার্নের উপাদান একটি '-' দ্বারা তার প্রতিবেশী থেকে পৃথক করা হয়। (fuzznuc এ ঐচ্ছিক)।
প্যাটার্নের একটি উপাদানের পুনরাবৃত্তি সেই উপাদান অনুসরণ করে নির্দেশ করা যেতে পারে
একটি সাংখ্যিক মান বা বন্ধনীর মধ্যে একটি সংখ্যাসূচক ব্যাপ্তি সহ। উদাহরণ: N(২০১০)
NNN এর সাথে মিলে যায়, N(2,4) NN বা NNN বা NNNN এর সাথে মিলে যায়। যখন একটি প্যাটার্ন হয়
একটি সিকোয়েন্সের 5' বা 3' শেষের মধ্যে সীমাবদ্ধ, সেই প্যাটার্নটি হয় একটি দিয়ে শুরু হয়
'<' চিহ্ন বা যথাক্রমে একটি '>' চিহ্ন দিয়ে শেষ হয়। একটি সময়কাল প্যাটার্ন শেষ হয়.
(fuzznuc এ ঐচ্ছিক)। উদাহরণস্বরূপ, [CG](5)TG{A}N(1,5)C
অগ্রসর অধ্যায়
- পরিপূরক বুলিয়ান
ডিফল্ট মান: N
আউটপুট অধ্যায়
-আউটফাইল রিপোর্ট
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে fuzznuce ব্যবহার করুন
