glam2-purge - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

glam2-purge - একটি FASTA ফাইল থেকে অপ্রয়োজনীয় সিকোয়েন্সগুলি সরিয়ে দেয়

সাইনোপিসিস

glam2-শুদ্ধ করা ফাইল স্কোর [অপশন]

বর্ণনাঃ

glam2-শুদ্ধ করা অ্যান্ড্রু নিউওয়াল্ডের একটি পরিবর্তিত সংস্করণ রেচক পদার্থ প্রোগ্রাম যা অপ্রয়োজনীয় অপসারণ করে
একটি FASTA ফাইল থেকে ক্রম। এটি অত্যন্ত অনুরূপ প্রতিরোধ করার জন্য সুপারিশ করা হয়
মোটিফের জন্য অনুসন্ধান বিকৃত ক্রম. Purge হয় DNA বা প্রোটিনের সাথে কাজ করে
সিকোয়েন্স তৈরি করে এবং একটি আউটপুট ফাইল তৈরি করে যাতে কোনো দুটি সিকোয়েন্সের একটি (গ্যাপলেস) স্থানীয় থাকে না
সারিবদ্ধকরণ স্কোর ব্যবহারকারীর দ্বারা নির্দিষ্ট একটি থ্রেশহোল্ডের চেয়ে বেশি। আউটপুট ফাইলের নাম দেওয়া হয়
. . অ্যালাইনমেন্ট স্কোর প্রোটিনের জন্য BLOSUM62 ম্যাট্রিক্সের উপর ভিত্তি করে এবং a এর উপর
DNA-এর জন্য +5/-1 স্কোরিং স্কিম। টেন্ডেমের পুনরাবৃত্তি মাস্ক করতেও পার্জ ব্যবহার করা যেতে পারে। এটি ব্যবহার করে
এই উদ্দেশ্যে XNU প্রোগ্রাম।

বিকল্প

-n
সিকোয়েন্স হল ডিএনএ (ডিফল্ট: প্রোটিন)।

-b
ব্লাস্ট হিউরিস্টিক পদ্ধতি ব্যবহার করুন (প্রোটিনের জন্য ডিফল্ট)।

-e
একটি সম্পূর্ণ পদ্ধতি ব্যবহার করুন (ডিএনএর জন্য ডিফল্ট)।

-q
সেটে প্রথম ক্রম রাখুন।

-x
প্রোটিন টেন্ডেম পুনরাবৃত্তি মাস্ক করতে xnu ব্যবহার করুন।

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে glam2-purge ব্যবহার করুন