এটি হল gmx-sans কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
gmx-sans - ছোট কোণ নিউট্রন বিক্ষিপ্ত বর্ণালী গণনা করুন
সাইনোপিসিস
জিএমএক্স সানস [-s [<.tpr>]] [-f [<.xtc/.trr/...>]] [-n [<.ndx>]]
[-d [<.dat>]] [-পিআর [<.xvg>]] [-বর্গ [<.xvg>]]
[-প্রফ্রেম [<.xvg>]] [-sqframe [<.xvg>]] [-b ]
[-e ] [-তারিখ ] [-আপনি ] [-xvg ]
[-বিন ] [-মোড ] [-mcover ]
[-পদ্ধতি ] [-[না]পিবিসি] [-গ্রিড ] [-startq ]
[-endq ] [-কস্টেপ ] [-বীজ ]
বর্ণনাঃ
জিএমএক্স ব্যতীত Debye সূত্র ব্যবহার করে SANS স্পেকট্রা গণনা করে। এটি বর্তমানে টপোলজি ফাইল ব্যবহার করে
(যেহেতু এটি প্রতিটি পরমাণুর জন্য উপাদান বরাদ্দ করতে হবে)।
পরামিতি:
-পিআর ট্র্যাজেক্টোরির উপর গড় স্বাভাবিক করা g(r) ফাংশন গণনা করে
-প্রফ্রেম প্রতিটি ফ্রেমের জন্য স্বাভাবিক করা g(r) ফাংশন গণনা করে
-বর্গ SANS তীব্রতার বক্ররেখার গড় গতিপথের উপর গণনা করে
-sqframe প্রতিটি ফ্রেমের জন্য SANS তীব্রতা বক্ররেখা গণনা করে
-startq nm এ q মান শুরু হচ্ছে
-endq nm এ q মান শেষ হচ্ছে
-কস্টেপ q স্থানে পা রাখা
দ্রষ্টব্য: Debye সরাসরি পদ্ধতি ব্যবহার করার সময় কম্পিউটেশনাল খরচ 1/2 * N * (N - 1) হিসাবে বৃদ্ধি পায়
যেখানে N হল আগ্রহের গ্রুপে পরমাণু সংখ্যা।
সতর্কতা: sq বা pr নির্দিষ্ট করা থাকলে এই টুলটি প্রচুর সংখ্যক ফাইল তৈরি করতে পারে! দুই পর্যন্ত
ফ্রেমের সংখ্যার চেয়ে বহুগুণ বড়!
বিকল্প
ইনপুট ফাইল নির্দিষ্ট করার বিকল্প:
-s [<.tpr>] (topol.tpr)
পোর্টেবল xdr রান ইনপুট ফাইল
-f [<.xtc/.trr/...>] (traj.xtc)
গতিপথ: পরমানন্দ trr CPT GRO g96 পিডিবি tng
-n [<.ndx>] (index.ndx) (ঐচ্ছিক)
ইনডেক্স ফাইল
-d [<.dat>] (nsfactor.dat) (ঐচ্ছিক)
জেনেরিক ডেটা ফাইল
আউটপুট ফাইল নির্দিষ্ট করার বিকল্প:
-পিআর [<.xvg>] (pr.xvg)
xvgr/xmgr ফাইল
-বর্গ [<.xvg>] (sq.xvg)
xvgr/xmgr ফাইল
-প্রফ্রেম [<.xvg>] (prframe.xvg) (ঐচ্ছিক)
xvgr/xmgr ফাইল
-sqframe [<.xvg>] (sqframe.xvg) (ঐচ্ছিক)
xvgr/xmgr ফাইল
অন্যান্য বিকল্পগুলি:
-b (0)
ট্রাজেক্টোরি থেকে পড়ার জন্য প্রথম ফ্রেম (ps)
-e (0)
ট্রাজেক্টোরি থেকে পড়ার জন্য শেষ ফ্রেম (ps)
-তারিখ (0)
শুধুমাত্র ফ্রেম ব্যবহার করুন যখন t MOD dt = প্রথমবার (ps)
-আপনি (দ্রষ্টব্য)
সময়ের মানের জন্য একক: fs, ps, ns, us, ms, s
-xvg
xvg প্লট বিন্যাস: xmgrace, xmgr, কোনোটিই নয়
-বিন (0.2)
[HIDDEN]বিনউইথ (এনএম)
-মোড (সরাসরি)
সান স্পেকট্রা গণনার জন্য মোড: সরাসরি, এমসি
-mcover (-1)
মন্টে-কার্লো কভারেজ হওয়া উচিত -1(ডিফল্ট) বা (0,1]
-পদ্ধতি (বিদায়)
[HIDDEN]স্যান স্পেকট্রা গণনার পদ্ধতি: ডেবাই, এফএফটি
-[না]পিবিসি (হ্যাঁ)
দূরত্ব গণনার জন্য পর্যায়ক্রমিক সীমানা শর্ত ব্যবহার করুন
-গ্রিড (0.05)
[HIDDEN]FFT-এর জন্য গ্রিড স্পেসিং (nm-এ)
-startq (0)
শুরু হচ্ছে q (1/nm)
-endq (2)
সমাপ্তি q (1/nm)
-কস্টেপ (0.01)
q (1/nm) এ পা দেওয়া
-বীজ (0)
মন্টে-কার্লো জন্য র্যান্ডম বীজ
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে gmx-sans ব্যবহার করুন
