এটি হল gmx-trjcat কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
gmx-trjcat - ট্রাজেক্টোরি ফাইলগুলিকে সংযুক্ত করুন
সাইনোপিসিস
gmx trjcat [-f [<.xtc/.trr/...> [...]]] [-n [<.ndx>]] [-ডেমাক্স [<.xvg>]]
[-o [<.xtc/.trr/...> [...]]] [-আপনি ] [-xvg ]
[-b ] [-e ] [-তারিখ ] [-[উপন্যাস]
[- [না] সেটটাইম] [- [না] বাছাই] [- [না] রাখা]
[- [না] ওভাররাইট করুন] [- [না] বিড়াল]
বর্ণনাঃ
জিএমএক্স trjcat সাজানো ক্রমে বেশ কয়েকটি ইনপুট ট্রাজেক্টোরি ফাইল সংযুক্ত করে। দ্বিগুণ ক্ষেত্রে
পরবর্তী ফাইলে টাইম ফ্রেম ব্যবহার করা হয়। নির্দিষ্ট করে -সেট সময় আপনাকে জিজ্ঞাসা করা হবে
প্রতিটি ফাইলের শুরুর সময়ের জন্য। ইনপুট ফাইল কমান্ড লাইন থেকে নেওয়া হয়, যেমন
যে একটি আদেশ মত জিএমএক্স trjcat -f *.trr -o fixed.trr কৌশলটি করা উচিত। ব্যবহার -বিড়াল, আপনি
অভিন্ন সময়ের সাথে ফ্রেম অপসারণ ছাড়াই একাধিক ফাইল একসাথে পেস্ট করতে পারে
স্ট্যাম্প।
একটি গুরুত্বপূর্ণ বিকল্প অনুমান করা হয় যখন আউটপুট ফাইলটি ইনপুট ফাইলগুলির মধ্যে থাকে। তার মধ্যে
ক্ষেত্রে সেই নির্দিষ্ট ফাইলটি যুক্ত করা হবে যা বোঝায় যে আপনাকে সংরক্ষণ করার দরকার নেই
ডাটার পরিমাণ দ্বিগুণ। স্পষ্টতই সংযুক্ত করার জন্য ফাইলটি সর্বনিম্ন সহ এক হতে হবে
শুরুর সময় যেহেতু একজন শুধুমাত্র একটি ফাইলের শেষে যোগ করতে পারে।
যদি -ডেমাক্স অপশন দেওয়া হয়েছে, N ট্রাজেক্টোরিগুলি যেগুলি পড়া হয়, অন্যটিতে লেখা হয়
আদেশ হিসাবে উল্লেখ করা হয়েছে .xvg ফাইল। দ্য .xvg ফাইলের মত কিছু থাকা উচিত:
0 0 1 2 3 4 5
2 1 0 2 3 5 4
প্রথম সংখ্যাটি সময়, এবং পরবর্তী সংখ্যাগুলি ট্র্যাজেক্টরি সূচকগুলি নির্দেশ করে। দ্য
প্রথম লাইনে উপস্থিত সংখ্যাগুলির সাথে সম্পর্কিত ফ্রেমগুলি তে সংগ্রহ করা হয়
আউটপুট গতিপথ। ট্র্যাজেক্টোরিতে ফ্রেমের সংখ্যা না মিললে যেটি তে
.xvg ফাইল তারপর প্রোগ্রাম স্মার্ট হতে চেষ্টা করে. সাবধান।
বিকল্প
ইনপুট ফাইল নির্দিষ্ট করার বিকল্প:
-f [<.xtc/.trr/...> [...]] (traj.xtc)
গতিপথ: পরমানন্দ trr CPT GRO g96 পিডিবি tng
-n [<.ndx>] (index.ndx) (ঐচ্ছিক)
ইনডেক্স ফাইল
-ডেমাক্স [<.xvg>] (remd.xvg) (ঐচ্ছিক)
xvgr/xmgr ফাইল
আউটপুট ফাইল নির্দিষ্ট করার বিকল্প:
-o [<.xtc/.trr/...> [...]] (trajout.xtc)
গতিপথ: পরমানন্দ trr GRO g96 পিডিবি tng
অন্যান্য বিকল্পগুলি:
-আপনি (দ্রষ্টব্য)
সময়ের মানের জন্য একক: fs, ps, ns, us, ms, s
-xvg
xvg প্লট বিন্যাস: xmgrace, xmgr, কোনোটিই নয়
-b (-1)
প্রথমবার ব্যবহার করার জন্য (ps)
-e (-1)
ব্যবহার করার শেষ সময় (ps)
-তারিখ (0)
শুধুমাত্র ফ্রেম লিখুন যখন t MOD dt = প্রথমবার (ps)
-[উপন্যাস (হ্যাঁ)
সম্ভব হলে বেগ পড়ুন এবং লিখুন
- [না] সেটটাইম (NO)
ইন্টারেক্টিভভাবে শুরুর সময় পরিবর্তন করুন
- [না] বাছাই (হ্যাঁ)
ট্র্যাজেক্টরি ফাইল বাছাই করুন (ফ্রেম নয়)
- [না] রাখা (NO)
গতিপথের শেষে ওভারল্যাপিং ফ্রেম রাখুন
- [না] ওভাররাইট করুন (NO)
সংযুক্ত করার সময় ওভারল্যাপিং ফ্রেমগুলি ওভাররাইট করুন
- [না] বিড়াল (NO)
ডবল টাইম ফ্রেম বাতিল করবেন না
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে gmx-trjcat ব্যবহার করুন
