gt-speck - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

gt-speck - GFF3 ইনপুটে বিশেষ সংজ্ঞা সম্মতি পরীক্ষা করে।

সাইনোপিসিস

gt ছত্রাক [বিকল্প] [GFF3_file...]

বর্ণনাঃ

-নির্দিষ্ট ফাইল [ফাইলের নাম]
স্পেসিফিকেশন সংজ্ঞা সহ ফাইল (ডিফল্ট: অনির্ধারিত)

রঙিন [হ্যাঁ|না]
রঙিন আউটপুট দেখান (ডিফল্ট: হ্যাঁ)

-সূচী প্রদান করুন [হ্যাঁ|না]
নির্দিষ্ট ফাইলের নামস্থানে বৈশিষ্ট্য সূচক প্রদান করুন (n ইনপুটের জন্য O(n) মেমরি প্রয়োজন
বৈশিষ্ট্য) (ডিফল্ট: না)

-সাজান [হ্যাঁ|না]
চেক করার আগে ইনপুট সাজান (n ইনপুট বৈশিষ্ট্যের জন্য O(n) মেমরি প্রয়োজন) (ডিফল্ট: না)

- ব্যর্থ [হ্যাঁ|না]
প্রক্রিয়াকরণ বন্ধ করুন এবং ফলাফলগুলিতে রেকর্ড করার পরিবর্তে রানটাইম ত্রুটিগুলি রিপোর্ট করুন
(ডিফল্ট: না)

-আউটপুট [স্ট্রিং]
আউটপুট ফরম্যাট থেকে বেছে নিন: json, text, html, statsonly (ডিফল্ট: টেক্সট)

-টাইপচেক [স্ট্রিং]
পিতামাতা-সন্তানের সম্পর্ক যাচাই করতে একটি OBO ফাইলে প্রদত্ত একটি অন্টোলজি ব্যবহার করুন। যদি না
যুক্তি দেওয়া হয়েছে, gtdata/obo_files ডিরেক্টরি থেকে sofa.obo ফাইলটি ব্যবহার করা হয়েছে। যদি
একটি যুক্তি দেওয়া হয়, এটি একটি OBO ফাইলের নাম হিসাবে ব্যবহৃত হয়। যে ক্ষেত্রে যেমন একটি ফাইল করে
অস্তিত্ব নেই .obo আর্গুমেন্টে যোগ করা হয় এবং এর থেকে ফাইলের নাম লোড করা হয়
gtdata/obo_files ডিরেক্টরি চেষ্টা করা হয়েছে। (ডিফল্ট: তাই)

- seqfile [ফাইলের নাম]
সিকোয়েন্স ফাইল সেট করুন যেখান থেকে সিকোয়েন্স নিতে হবে (ডিফল্ট: অনির্ধারিত)

-encseq [ফাইলের নাম]
এনকোডেড সিকোয়েন্স ইনডেক্সনাম সেট করুন যেখান থেকে সিকোয়েন্স নিতে হবে (ডিফল্ট:
অনির্ধারিত)

- seqfiles
সিকোয়েন্স ফাইল সেট করুন যেখান থেকে ফিচার ব্যবহার করে বের করতে হবে -- তালিকাটি শেষ করতে
অনুক্রম ফাইলের

- ম্যাচডেস্ক [হ্যাঁ|না]
পছন্দসই সিকোয়েন্স আইডিগুলির জন্য ইনপুট ফাইলগুলি থেকে অনুক্রমের বিবরণ অনুসন্ধান করুন (ইন
GFF3), প্রথম ম্যাচ রিপোর্ট করা (ডিফল্ট: না)

-ম্যাচডেস্কস্টার্ট [হ্যাঁ|না]
পছন্দসই অনুক্রমের জন্য ইনপুট ফাইল থেকে অনুক্রমের বর্ণনার সাথে হুবহু মিলে যায়
আইডি (GFF3 এ) শুরু থেকে প্রথম হোয়াইটস্পেস পর্যন্ত (ডিফল্ট: না)

- usedesc [হ্যাঁ|না]
সিকোয়েন্স আইডি ম্যাপ করার জন্য সিকোয়েন্স বর্ণনা ব্যবহার করুন (GFF3-এ) আসল সিকোয়েন্সে
এন্ট্রি যদি একটি বিবরণে একটি ক্রম পরিসীমা থাকে (যেমন, III:1000001..2000000),
প্রথম অংশ সিকোয়েন্স আইডি হিসাবে ব্যবহার করা হয় (তৃতীয়) এবং অফসেট হিসাবে প্রথম পরিসরের অবস্থান
(1000001) (ডিফল্ট: না)

- অঞ্চল ম্যাপিং [স্ট্রিং]
সিকোয়েন্স-অঞ্চল সমন্বিত ফাইলকে সিকোয়েন্স ফাইল ম্যাপিং-এ সেট করুন (ডিফল্ট: অনির্ধারিত)

-o [ফাইলের নাম]
নির্দিষ্ট ফাইলে আউটপুট পুনঃনির্দেশিত (ডিফল্ট: অনির্ধারিত)

-জিজিপ [হ্যাঁ|না]
gzip সংকুচিত আউটপুট ফাইল লিখুন (ডিফল্ট: না)

-bzip2 [হ্যাঁ|না]
bzip2 সংকুচিত আউটপুট ফাইল লিখুন (ডিফল্ট: না)

- বল [হ্যাঁ|না]
আউটপুট ফাইলে জোর করে লেখা (ডিফল্ট: না)

-v [হ্যাঁ|না]
শব্দযুক্ত হতে (ডিফল্ট: না)

-হেল্প
সাহায্য প্রদর্শন এবং প্রস্থান

-version
সংস্করণ তথ্য প্রদর্শন করুন এবং প্রস্থান করুন

প্রতিবেদনের বাগ

বাগ রিপোর্ট করুন[ইমেল সুরক্ষিত]>.

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে gt-speck ব্যবহার করুন