এটি হল hmm2fetch কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
hmm2fetch - একটি HMM ডাটাবেস থেকে একটি HMM পুনরুদ্ধার করুন
সাইনোপিসিস
hmm2 আনা [বিকল্প] ডাটাবেজ নাম
বর্ণনাঃ
hmm2 আনা একটি ছোট ইউটিলিটি যা একটি HMM নামক পুনরুদ্ধার করে নাম একটি HMMER মডেল ডাটাবেস থেকে
নামক ডাটাবেস। একটি নতুন বিন্যাসে, এবং আদর্শ আউটপুটে সেই মডেলটি প্রিন্ট করে। উদাহরণ স্বরূপ,
hmm2 আনা Pfam rrm Pfam থেকে RRM (RNA রিকগনিশন মোটিফ) মডেল পুনরুদ্ধার করে, যদি
পরিবেশ পরিবর্তনশীল HMMERDB Pfam ডাটাবেসের অবস্থানে সেট করা হয়েছে। উদ্ধার করা হয়েছে
HMM ফাইলটি HMMER 2 ASCII ফরম্যাটে লেখা হয়।
ডাটাবেসের একটি সংশ্লিষ্ট GSI সূচক ফাইল থাকতে হবে। একটি HMM ডাটাবেস সূচক করতে, ব্যবহার করুন
কার্যক্রম hmm2 index.
বিকল্প
-h সংক্ষিপ্ত সাহায্য মুদ্রণ; সংস্করণ নম্বর এবং সমস্ত বিকল্পের সারাংশ অন্তর্ভুক্ত, সহ
বিশেষজ্ঞের বিকল্প।
-n ব্যাখ্যা করা নাম একটি নামের পরিবর্তে একটি HMM নম্বর হিসাবে। সংখ্যায়ন শুরু হয় 0 থেকে। এর জন্য
উদাহরণস্বরূপ, একটি HMM ডাটাবেস থেকে প্রথম HMM আনার জন্য ফু, আপনি করতে হবে
hmm2 আনা -n 0 foo
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে hmm2fetch অনলাইন ব্যবহার করুন
