এটি হল idfetch কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
idfetch - NCBI ID1 সার্ভার থেকে জৈবিক তথ্য পুনরুদ্ধার করুন
সাইনোপিসিস
idfetch [-] [-F Str] [-G ফাইলের নাম] [-Q ফাইলের নাম] [-c N] [-d Str] [-e N] [-f Str] [-g N]
[-i N] [-l ফাইলের নাম] [-n] [-o ফাইলের নাম] [-q Str] [-s Str] [-t N]
বর্ণনাঃ
idfetch NCBI এর ID1 সার্ভারের একটি ক্লায়েন্ট, যেটিতে টীকাগুলির একটি বড় ডাটাবেস রয়েছে
জৈবিক ক্রম
বিকল্প
বিকল্পগুলির একটি সারাংশ নীচে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে।
- প্রিন্ট ব্যবহার বার্তা
-F Str নির্দিষ্ট বৈশিষ্ট্যের ধরন যোগ করুন (কমা দ্বারা সীমাবদ্ধ); অনুমোদিত মান হল CDD, SNP,
SNP_graph, MGC, HPRD, STS, tRNA, এবং microRNA।
-G ফাইলের নাম
ডাম্প করার জন্য GI, (সংস্করণ) অ্যাক্সেস, FASTA SeqID এর তালিকা সহ ফাইল করুন
-Q ফাইলের নাম
Entrez ক্যোয়ারী দ্বারা GI তালিকা তৈরি করুন ফাইলের নাম; প্রয়োজন -ডিএন or -ডিপি.
-c N সর্বাধিক জটিলতা:
0 পুরো ব্লব পান (ডিফল্ট)
1 সুদের বায়োসেক পান
2 আগ্রহের বায়োসেক ধারণকারী ন্যূনতম বায়োসেক-সেট পান
3 আগ্রহের বায়োসেক ধারণকারী ন্যূনতম nuc-প্রোট পান
4 আগ্রহের বায়োসেক ধারণকারী ন্যূনতম পাব-সেট পান
-d Str ব্যবহার করার জন্য ডাটাবেস (সহ -q, যেকোনটিই হতে পারে n নিউক্লিওটাইডের জন্য বা p প্রোটিনের জন্য)।
-e N ডাম্প করার জন্য সত্তা নম্বর (পুনরুদ্ধার নম্বর)
-f Str সমতল SeqId. সম্ভাব্য বিন্যাস:
আদর্শ([নাম][,[প্রবেশ][,[মুক্তি[,সংস্করণ]]]) '5(HUMHBB)' হিসাবে
আদর্শ=প্রবেশ
আদর্শ:সংখ্যা
(আদর্শ ASN.1 Seq-id সাবটাইপ নির্দেশ করে এমন একটি সংখ্যা।)
-g N ডাম্প করার জন্য একক সত্তার জন্য জিআই আইডি
-i N সন্ধানের ধরন:
0 Seq-এন্ট্রি পান (ডিফল্ট)
1 জিআই স্টেট পান (আউটপুট থেকে stderr)
2 SeqIds পান
3 জিআই ইতিহাস পান (শুধুমাত্র ক্রম পরিবর্তন)
4 পুনর্বিবেচনার ইতিহাস পান (ASN.1-তে যেকোনো পরিবর্তন)
-l ফাইলের নাম
লগ ফাইল
-n আউটপুট শুধুমাত্র GI-এর তালিকা (সহ -q এবং -Q).
-o ফাইলের নাম
আউটপুটের জন্য ফাইলের নাম (ডিফল্ট = stdout)
-q Str Entrez ক্যোয়ারী দ্বারা gi তালিকা তৈরি করুন. প্রয়োজন -ডিএন or -ডিপি.
-s Str FASTA শৈলী SeqId উদ্ধৃতিতে সংযুক্ত। বিন্যাস:
lcl|কোন int or Str
bbs|কোন int
bbm|কোন int
gb|এক্সেসরিজ|এলওসি
emb|এক্সেসরিজ|এলওসি
পীর |এক্সেসরিজ|নাম
sp|এক্সেসরিজ|নাম
প্যাট|দেশ|পেটেণ্ট|SeQ
gi|কোন int
ডিবিজে|এক্সেসরিজ|এলওসি
prf|এক্সেসরিজ|নাম
pdb|প্রবেশ|চেন
-t N আউটপুট ধরণ:
1টি পাঠ্য ASN.1 (ডিফল্ট)
2 বাইনারি ASN.1
3 GenBank (শুধুমাত্র Seq-এন্ট্রি)
4 GenPept (শুধুমাত্র সেক-এন্ট্রি)
5 FASTA (ইতিহাসের জন্য টেবিল)
6 গুণমানের স্কোর (শুধুমাত্র সেক-এন্ট্রি)
7 Entrez ডকসাম
8 FASTA বিপরীত পরিপূরক
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে idfetch ব্যবহার করুন
