এটি হল macs2_bdgbroadcall কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
macs2_bdgbroadcall - চিপ-সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য মডেল-ভিত্তিক বিশ্লেষণ
বর্ণনাঃ
ব্যবহার: macs2 bdgbroadcall [-h] -i IFLE [-c CUTOFFPEAK] [-C CUTOFFLINK]
[-l MINLEN] [-g LVL1MAXGAP] [-G LVL2MAXGAP]
[-আউটডির OUTDIR] (-o OFILE | --o-উপসর্গ OPREFIX)
ঐচ্ছিক যুক্তি:
-h, --help
এই সাহায্য বার্তাটি দেখান এবং প্রস্থান করুন
-i আইএফএল, --ফাইল আইএফএল
বেডগ্রাফে MACS স্কোর। প্রয়োজন
-c কাটফপিক, -- কাটঅফ-চূড়া কাটফপিক
স্কোর ট্র্যাকের জন্য আপনি কোন পদ্ধতি ব্যবহার করেছেন তার উপর নির্ভর করে শিখরের জন্য কাটঅফ। ফাইল হলে
MACS2 থেকে qvalue স্কোর রয়েছে, স্কোর 2 মানে qvalue 0.01। ডিফল্ট: 2
-C CUTOFFLINK, --কাটঅফ-লিঙ্ক CUTOFFLINK
আপনি কোন পদ্ধতি ব্যবহার করেছেন তার উপর নির্ভর করে অঞ্চল/কম প্রাচুর্য অঞ্চলগুলিকে লিঙ্ক করার জন্য কাটঅফ
স্কোর ট্র্যাকের জন্য। ফাইলটিতে MACS2 থেকে qvalue স্কোর থাকলে, স্কোর 1 মানে
qvalue 0.1, এবং স্কোর 0.3 মানে qvalue 0.5। ডিফল্ট: 1
-l মিনলেন, --মিনিট-দৈর্ঘ্য মিনলেন
পিকের ন্যূনতম দৈর্ঘ্য, এটিকে ডি মান হিসাবে সেট করা ভাল। ডিফল্ট: 200
-g LVL1MAXGAP, --lvl1-max-ব্যবধান LVL1MAXGAP
উল্লেখযোগ্য শিখরগুলির মধ্যে সর্বাধিক ব্যবধান, এটিকে ট্যাগ আকার হিসাবে সেট করা ভাল। ডিফল্ট: 30
-G LVL2MAXGAP, --lvl2-max-ব্যবধান LVL2MAXGAP
উল্লেখযোগ্য শিখরগুলির মধ্যে সর্বাধিক লিঙ্কিং, এটিকে d মানের 4 গুণ হিসাবে সেট করা ভাল।
ডিফল্ট: 800
-- বাইরে OUTDIR
নির্দিষ্ট করা হলে সমস্ত আউটপুট ফাইল সেই ডিরেক্টরিতে লেখা হবে। ডিফল্ট: the
বর্তমান কাজের ডিরেক্টরি
-o OFILE, --অফিল অফাইল
আউটপুট ফাইলের নাম. সঙ্গে পারস্পরিক একচেটিয়া --o-উপসর্গ.
--o-উপসর্গ OPREFIX
আউটপুট ফাইলের উপসর্গ। সঙ্গে পারস্পরিক একচেটিয়া -o/---অফিল।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে macs2_bdgbroadcall ব্যবহার করুন
