এটি হল macs2_bdgopt কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
macs2_bdgopt - চিপ-সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য মডেল-ভিত্তিক বিশ্লেষণ
বর্ণনাঃ
ব্যবহার: macs2 bdgopt [-h] -i IFILE [-m {multiply,add,p2q}]
[-p [এক্সট্রাপারম [এক্সট্রাপারম...]]] [--আউটডির আউটডির] -o
অফাইল
ঐচ্ছিক যুক্তি:
-h, --help
এই সাহায্য বার্তাটি দেখান এবং প্রস্থান করুন
-i আইএফএল, --ফাইল আইএফএল
বেডগ্রাফে MACS স্কোর। দ্রষ্টব্য: এটি অবশ্যই একটি বেডগ্রাফ ফাইল হতে হবে যা সমগ্রকে কভার করে
জিনোম প্রয়োজন
-m {গুণ, যোগ, p2q}, --পদ্ধতি {গুণ, যোগ, p2q}
বেডগ্রাফ ফাইলের স্কোর কলাম পরিবর্তন করার পদ্ধতি। উপলব্ধ পছন্দ হল:
গুণ, যোগ বা p2q। 1) গুণ করুন, EXTRAPARAM প্রয়োজন এবং হবে
স্কোর কলামে গুণিত। আপনি যদি X দ্বারা স্কোর কলাম ভাগ করতে চান তবে ব্যবহার করুন
EXTRAPARAM হিসাবে 1/X এর মান। 2) যোগ করুন, EXTRAPARAM প্রয়োজন এবং এতে যোগ করা হবে
স্কোর কলাম। আপনি যদি X দ্বারা স্কোর কলাম বিয়োগ করতে চান, তাহলে এর মান ব্যবহার করুন -X
EXTRAPARAM হিসাবে। 3) p2q, এটি ব্যবহার করে p-মান স্কোরকে q-মান স্কোরে রূপান্তর করবে
বেঞ্জামিনী-হচবার্গ প্রক্রিয়া। EXTRAPARAM এর প্রয়োজন নেই। এই পদ্ধতি অনুমান
স্কোর হয় -log10 MACS2 থেকে p-মান। স্কোর অন্য কোন ধরনের কারণ হবে
অপ্রত্যাশিত ত্রুটি।
-p [এক্সট্রাপারম [এক্সট্রাপারম...]], --অতিরিক্ত-পরম [এক্সট্রাপারম [এক্সট্রাপারম...]]
পদ্ধতির জন্য অতিরিক্ত পরামিতি। বিস্তারিত চেক করুন -m বিকল্প।
-- বাইরে OUTDIR
নির্দিষ্ট করা হলে সমস্ত আউটপুট ফাইল সেই ডিরেক্টরিতে লেখা হবে। ডিফল্ট: the
বর্তমান কাজের ডিরেক্টরি
-o OFILE, --অফিল অফাইল
আউটপুট BEDGraph ফাইলের নাম।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে macs2_bdgopt ব্যবহার করুন
