āĻāĻāĻŋ āĻšāĻ˛ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ2āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽā§āĻĒ āĻāĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄ āĻ¯āĻž āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻāĻ¸ā§āĻā§āĻļāĻ¨ āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨ āĻāĻŦā§āĻ¨ā§āĻā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻĢā§āĻĄā§āĻ°āĻž āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻāĻāĻ¨ā§āĻĄā§āĻ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦāĻž MAC OS āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ OnWorks āĻĢā§āĻ°āĻŋ āĻšā§āĻ¸ā§āĻāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¤ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§ āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤
āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¯āĻā§āĻ°āĻŽ:
NAME āĻāĻ°
map2slim - āĻāĻāĻāĻŋ 'āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ' āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ¤ā§ āĻāĻŋāĻ¨ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ¸ā§āĻ¸āĻŋāĻ¯āĻŧā§āĻļāĻ¨ā§āĻ° āĻŽāĻžāĻ¨āĻāĻŋāĻ¤ā§āĻ°
āĻ¸āĻžāĻāĻ¨ā§āĻĒāĻŋāĻ¸āĻŋāĻ¸
āĻ¸āĻŋāĻĄāĻŋ āĻ¯āĻžāĻ¨
map2slim GO_slims/goslim_generic.obo ontology/gene_ontology.obo gene-associations/gene_association.fb
āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻžāĻ
āĻāĻāĻāĻŋ GO āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻāĻŦāĻ āĻāĻāĻāĻŋ āĻŦāĻ°ā§āĻ¤āĻŽāĻžāĻ¨ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ āĻĻā§āĻāĻ¯āĻŧāĻž (āĻāĻ āĻŦāĻž āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§), āĻāĻ āĻ¸ā§āĻā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻāĻāĻŋ āĻŽāĻžāĻ¨āĻāĻŋāĻ¤ā§āĻ° āĻāĻ°āĻŦā§
āĻāĻāĻāĻŋ āĻāĻŋāĻ¨ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ¸ā§āĻ¸āĻŋāĻ¯āĻŧā§āĻļāĻ¨ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ (āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ GO-āĻ¤ā§ āĻā§āĻāĻž āĻ§āĻžāĻ°āĻŖ āĻāĻ°ā§) GO-āĻāĻ° āĻļāĻ°ā§āĻ¤āĻžāĻŦāĻ˛ā§āĻ¤ā§
āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž
āĻ¸ā§āĻā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻāĻāĻŋ āĻšāĻ¯āĻŧ āĻāĻāĻāĻŋ āĻ¨āĻ¤ā§āĻ¨ āĻāĻŋāĻ¨ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ¸ā§āĻ¸āĻŋāĻ¯āĻŧā§āĻļāĻ¨ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻ¤ā§āĻ°āĻŋ āĻāĻ°āĻ¤ā§ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°āĻž āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§, āĻ¯āĻžāĻ° āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ āĻ¸āĻ°ā§āĻŦāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻ°āĻ¯āĻŧā§āĻā§
āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¸āĻā§āĻāĻŋāĻ GO āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻ¸ā§āĻ¸, āĻŦāĻž āĻāĻžāĻāĻ¨ā§āĻ-āĻŽā§āĻĄā§, āĻ¯ā§ āĻā§āĻˇā§āĻ¤ā§āĻ°ā§ āĻāĻāĻŋ āĻ¸ā§āĻŦāĻ¤āĻ¨ā§āĻ¤ā§āĻ° āĻāĻŋāĻ¨ āĻĻā§āĻŦā§
āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻāĻŋ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻŽā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻĻā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻĒāĻŖā§āĻ¯ āĻāĻŖāĻ¨āĻž
āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ¸ā§āĻ¸āĻŋāĻ¯āĻŧā§āĻļāĻ¨ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻŦāĻŋāĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¸ āĻāĻāĻžāĻ¨ā§ āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻž āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§:
<http://www.geneontology.org/GO.annotation.shtml#āĻĢāĻžāĻāĻ˛>
āĻ¯ā§āĻā§āĻ¤āĻŋ
-b āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻĢāĻžāĻāĻ˛
āĻāĻ āĻ¯ā§āĻā§āĻ¤āĻŋ āĻ¯ā§āĻ āĻāĻ°ā§ āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻļāĻ°ā§āĻ¤āĻžāĻŦāĻ˛ā§ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ¤ā§; āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ¨ā§āĻā§āĻ° āĻĄāĻā§āĻŽā§āĻ¨ā§āĻā§āĻļāĻ¨ āĻĻā§āĻā§āĻ¨
āĻāĻāĻāĻŋ āĻŦā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻ¯āĻž. āĻ¨āĻ¤ā§āĻ¨ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ āĻĢāĻžāĻāĻ˛, āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻĒāĻĻ āĻ¸āĻš āĻ˛āĻŋāĻāĻŋāĻ¤ āĻšāĻŦā§
āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻĢāĻžāĻāĻ˛
-āĻāĻāĻāĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŋāĻ āĻĢāĻžāĻāĻ˛
āĻāĻāĻŋ āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ¤ā§ āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻāĻŋ āĻĒāĻĻā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻāĻŋ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŋāĻ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻ¤ā§āĻ°āĻŋ āĻāĻ°āĻŦā§ āĻ¯āĻž āĻāĻāĻ¯āĻŧāĻ āĻĻā§āĻāĻžāĻā§āĻā§
āĻ¸āĻŦāĻā§āĻ¯āĻŧā§ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¸āĻā§āĻāĻŋāĻ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻāĻžāĻ°ā§āĻŽ āĻāĻŦāĻ āĻ¸āĻŽāĻ¸ā§āĻ¤ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻāĻžāĻ°ā§āĻŽ āĻ¯āĻž āĻĒā§āĻ°ā§āĻŦāĻĒā§āĻ°ā§āĻˇāĨ¤ āĻāĻĒāĻ¨āĻŋ āĻ¯āĻĻāĻŋ āĻāĻāĻŋ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§āĻ¨
āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ, āĻāĻāĻāĻŋ āĻāĻŋāĻ¨-āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ¸ā§āĻ¸āĻŋāĻ¯āĻŧā§āĻļāĻ¨ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻ¸āĻ°āĻŦāĻ°āĻžāĻš āĻāĻ°āĻŦā§āĻ¨ āĻ¨āĻž
āĻļā§āĻ¨ā§āĻŽ
(āĻļā§āĻ§ā§āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° -āĻāĻāĻāĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻāĻžāĻ āĻāĻ°ā§)
āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŋāĻ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§ āĻļāĻŦā§āĻĻā§āĻ° āĻ¨āĻžāĻŽ āĻĻā§āĻāĻžāĻ¨
-c āĻāĻāĻŋ map2slim āĻā§ assoc āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§āĻ° āĻāĻŖāĻ¨āĻž āĻĻāĻŋāĻ¤ā§ āĻŦāĻžāĻ§ā§āĻ¯ āĻāĻ°āĻŦā§, āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻāĻ°āĻžāĻ° āĻĒāĻ°āĻŋāĻŦāĻ°ā§āĻ¤ā§
-t āĻāĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ˛ā§ -c āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ āĻā§āĻ¯āĻžāĻŦ āĻāĻ°āĻŦā§ āĻ¯āĻžāĻ¤ā§ āĻāĻ¨ā§āĻĄā§āĻ¨ā§āĻā§āĻļāĻ¨ āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻĢāĻ˛āĻŋāĻ¤ āĻšāĻ¯āĻŧ
āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§ āĻāĻžāĻā§āĻ° āĻļā§āĻ°ā§āĻŖāĻŋāĻŦāĻŋāĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¸
-o āĻŦāĻžāĻāĻ°ā§ āĻĢāĻžāĻāĻ˛
āĻāĻāĻŋ āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻĻāĻŋāĻˇā§āĻ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻāĻ°āĻž āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ¸ā§āĻāĻ¸ (āĻŦāĻž āĻāĻŖāĻ¨āĻž) āĻ˛āĻŋāĻāĻŦā§, āĻāĻ° āĻĒāĻ°āĻŋāĻŦāĻ°ā§āĻ¤ā§
āĻĒāĻ°ā§āĻĻāĻžāĻāĻŋ
āĻĄāĻžāĻāĻ¨āĻ˛ā§āĻĄ
āĻāĻ āĻ¸ā§āĻā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻ āĻāĻ° āĻ āĻāĻļ go-perl āĻĒā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻ, CPAN āĻĨā§āĻā§ āĻāĻĒāĻ˛āĻŦā§āĻ§
<http://search.cpan.org/~cmungall/go-perl/>
āĻāĻ āĻ¸ā§āĻā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻāĻāĻŋ go-perl āĻāĻ¨āĻ¸ā§āĻāĻ˛ āĻ¨āĻž āĻāĻ°ā§ āĻāĻžāĻ āĻāĻ°āĻŦā§ āĻ¨āĻž
āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŋāĻ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ˛āĻāĻ°āĻŋāĻĨ
GO āĻāĻāĻāĻŋ DAG, āĻāĻāĻāĻŋ āĻāĻžāĻ āĻ¨āĻ¯āĻŧāĨ¤ āĻāĻ° āĻŽāĻžāĻ¨ā§ āĻšāĻ˛ āĻ¯ā§ āĻāĻāĻāĻŋ GO āĻļāĻŦā§āĻĻ āĻĨā§āĻā§ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¯āĻŧāĻļāĻ āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻĒāĻĨ āĻĨāĻžāĻā§
āĻŽā§āĻ˛ Gene_Ontology āĻ¨ā§āĻĄ āĻĒāĻ°ā§āĻ¯āĻ¨ā§āĻ¤; āĻĒāĻžāĻĨ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻĒāĻĻ āĻā§āĻĻ āĻāĻ°āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§
āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ - āĻ¯āĻžāĻ° āĻŽāĻžāĻ¨ā§ āĻšāĻ˛ āĻ¯ā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻā§āĻāĻž āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻĒāĻĻā§ āĻŽāĻžāĻ¨āĻāĻŋāĻ¤ā§āĻ° āĻāĻ°āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§!
(āĻŦāĻŋāĻāĻĻā§āĻ°āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ° āĻāĻŦāĻŋāĻāĻŋ āĻĻā§āĻāĻ¤ā§ āĻāĻĒāĻ¨āĻžāĻā§ āĻāĻāĻŋ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ āĻĻā§āĻāĻ¤ā§ āĻšāĻŦā§ - āĻ¯āĻĻāĻŋ āĻāĻĒāĻ¨āĻŋ āĻāĻāĻŋ āĻĻā§āĻāĻ¤ā§ āĻ¨āĻž āĻĒāĻžāĻ¨
āĻĻā§āĻ¯ http://www.geneontology.org āĻ¸āĻžāĻāĻ, āĻāĻĒāĻ¨āĻŋ āĻ¨āĻŋāĻŽā§āĻ¨āĻ˛āĻŋāĻāĻŋāĻ¤ URL āĻĻā§āĻāĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĻ¨:
<http://geneontology.cvs.sourceforge.net/*āĻā§āĻāĻāĻāĻ*/geneontology/go-dev/go-perl/doc/map2slim.gif>
)
āĻāĻāĻāĻŋ āĻ āĻ¨ā§āĻŽāĻžāĻ¨āĻŽā§āĻ˛āĻ āĻāĻĻāĻžāĻšāĻ°āĻŖ āĻ¨ā§āĻ˛ āĻā§āĻ¨āĻžāĻļā§āĻ¨āĻžāĻā§āĻ˛āĻŋ GO āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽā§ āĻĒāĻĻāĻā§āĻ˛āĻŋ āĻĻā§āĻāĻžāĻ¯āĻŧ āĻāĻŦāĻ āĻšāĻ˛ā§āĻĻ āĻŦā§āĻ¤ā§āĻ¤āĻā§āĻ˛āĻŋ āĻĻā§āĻāĻžāĻ¯āĻŧā§ˇ
āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ¤ā§ āĻļāĻ°ā§āĻ¤āĻžāĻŦāĻ˛ā§āĨ¤ āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ¸āĻžāĻŦāĻ¸ā§āĻŽ āĻāĻ°ā§, āĻ¤āĻžāĻ āĻ¨ā§āĻ˛ āĻĒāĻĻ
āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ¤ā§āĻāĨ¤
āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻāĻāĻĄāĻŋ āĻ¸āĻŽāĻ¸ā§āĻ¤ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŦāĻĒā§āĻ°ā§āĻˇāĻĻā§āĻ° āĻāĻāĻĄāĻŋ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻ¯āĻžāĻ¨
====================================
5 2+3 2,3,1
6 3 āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° 3,1
7 4 āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° 4,3,1
8 3 āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° 3,1
9 4 āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° 4,3,1
10 2+3 2,3,1
2āĻ¯āĻŧ āĻāĻ˛āĻžāĻŽāĻāĻŋ āĻ¸āĻ°āĻžāĻ¸āĻ°āĻŋ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŋāĻāĻ¯āĻŧā§āĻ° āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ āĻ¸āĻŦāĻā§āĻ¯āĻŧā§ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¸āĻā§āĻāĻŋāĻ āĻāĻāĻĄāĻŋ(āĻā§āĻ˛āĻŋ) āĻĻā§āĻāĻžāĻ¯āĻŧāĨ¤ ā§ŠāĻ¯āĻŧ
āĻāĻ˛āĻžāĻŽ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ¸āĻŦ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŦāĻĒā§āĻ°ā§āĻˇ āĻĻā§āĻāĻžāĻ¯āĻŧ.
āĻāĻāĻĄāĻŋ 9 āĻāĻ° āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŋāĻ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻˇāĻāĻžāĻŦā§ āĻ¨ā§āĻ āĻāĻ°ā§āĻ¨ āĻ¯āĻĻāĻŋāĻ āĻāĻāĻŋ āĻ°ā§āĻ āĻāĻ° āĻŽāĻžāĻ§ā§āĻ¯āĻŽā§ āĻĻā§āĻāĻŋ āĻĒāĻĨ āĻāĻā§
3 āĻāĻŦāĻ 4, 3 āĻāĻ° āĻŽāĻžāĻ§ā§āĻ¯āĻŽā§ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽāĻāĻŋ āĻŦāĻžāĻ¤āĻŋāĻ˛ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§ āĻāĻžāĻ°āĻŖ āĻāĻāĻŋ 4 āĻĻā§āĻŦāĻžāĻ°āĻž āĻ¸āĻžāĻŦāĻŽāĻŋāĻĄ āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§āĨ¤
āĻ āĻ¨ā§āĻ¯āĻĻāĻŋāĻā§, 10 āĻāĻŦāĻ 2 āĻāĻāĻ¯āĻŧā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ 3āĻāĻŋ āĻŽāĻžāĻ¨āĻāĻŋāĻ¤ā§āĻ° āĻāĻžāĻ°āĻŖ āĻāĻ āĻĻā§āĻāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻĨāĻŽ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻāĻāĻĄāĻŋ
āĻŽā§āĻ˛ā§āĻ° āĻĻā§āĻāĻŋ āĻŦā§āĻ§ āĻĒāĻĨ, āĻāĻŦāĻ āĻā§āĻ¨āĻāĻŋāĻ āĻ āĻ¨ā§āĻ¯āĻāĻŋāĻā§ āĻ¸āĻžāĻŦāĻ¸āĻŽ āĻāĻ°ā§ āĻ¨āĻžāĨ¤
āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšā§āĻ¤ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ˛āĻāĻ°āĻŋāĻĻāĻŽ āĻšāĻ˛:
āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ¤ā§ āĻ¯ā§āĻā§āĻ¨ āĻāĻāĻāĻŋ āĻāĻžāĻ°ā§āĻŽ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻāĻ°āĻ¤ā§: āĻ°ā§āĻ āĻ¨ā§āĻĄā§āĻ° āĻŽāĻžāĻ§ā§āĻ¯āĻŽā§ āĻ¸āĻŽāĻ¸ā§āĻ¤ āĻŦā§āĻ§ āĻĒāĻĨ āĻā§āĻāĻā§āĻ¨
āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ
āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻāĻŋ āĻĒāĻĨā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯, āĻĒāĻžāĻĨā§āĻ° āĻ¸āĻŽā§āĻŽā§āĻā§āĻ¨ āĻšāĻāĻ¯āĻŧāĻž āĻĒā§āĻ°āĻĨāĻŽ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻļāĻŦā§āĻĻāĻāĻŋ āĻ¨āĻŋāĻ¨
āĻāĻ āĻ¸ā§āĻā§ āĻ¯ā§āĻā§āĻ¨ā§ āĻ āĻĒā§āĻ°āĻ¯āĻŧā§āĻāĻ¨ā§āĻ¯āĻŧ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĒāĻĻ āĻŦāĻžāĻĻ āĻĻāĻŋāĻ¨ āĻ āĻ°ā§āĻĨāĻžā§ āĻ āĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĒāĻĻ āĻĻā§āĻŦāĻžāĻ°āĻž āĻ¸āĻāĻ¯ā§āĻāĻŋāĻ¤ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĒāĻĻ
āĻ¸ā§āĻā§
āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻļāĻ°ā§āĻ¤āĻā§āĻ˛āĻŋ
āĻāĻĒāĻ¨āĻŋ āĻ¯āĻĻāĻŋ -b āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻ¸ā§āĻā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻāĻāĻŋ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨, āĻ¤āĻžāĻšāĻ˛ā§ āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻĒāĻĻ āĻ¯ā§āĻ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻŦā§āĨ¤ āĻ¯ā§āĻā§āĻ¨ā§ āĻŽā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻĻā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ P āĻāĻ¨
āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž, āĻ¯āĻĻāĻŋ P āĻāĻ° āĻ āĻ¨ā§āĻ¤āĻ¤ āĻāĻāĻāĻŋ āĻļāĻŋāĻļā§ C āĻĨāĻžāĻā§, P āĻāĻ° āĻ āĻ§ā§āĻ¨ā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻļāĻŦā§āĻĻ P' āĻ¤ā§āĻ°āĻŋ āĻšāĻŦā§āĨ¤
āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ¤ā§ āĻ¯ā§ āĻā§āĻ¨āĻ āĻļāĻŦā§āĻĻ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻāĻ°āĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻāĻŋ āĻā§āĻ¯āĻžāĻ-āĻ āĻ˛ āĻļāĻŦā§āĻĻ āĻ¯āĻž P āĻāĻ° āĻŦāĻāĻļāĻ§āĻ°, āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻ¤ā§
āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ¤ā§ P-āĻāĻ° āĻā§āĻ¨ā§ āĻ¸āĻ¨ā§āĻ¤āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻŦāĻāĻļāĻ§āĻ° āĻ¨āĻ¯āĻŧāĨ¤
āĻāĻĻāĻžāĻšāĻ°āĻŖāĻ¸ā§āĻŦāĻ°ā§āĻĒ, slim generic.0208 āĻāĻ° āĻ¨āĻŋāĻŽā§āĻ¨āĻ˛āĻŋāĻāĻŋāĻ¤ āĻļāĻ°ā§āĻ¤āĻžāĻŦāĻ˛ā§ āĻāĻŦāĻ āĻāĻžāĻ āĻžāĻŽā§ āĻ°āĻ¯āĻŧā§āĻā§:
%āĻĄāĻŋāĻāĻ¨āĻ āĻŦāĻžāĻāĻ§āĻžāĻ ; āĻ¯āĻžāĻ¨: 0003677
% āĻā§āĻ°ā§āĻŽāĻžāĻāĻŋāĻ¨ āĻŦāĻžāĻāĻ§āĻžāĻ; āĻ¯āĻžāĻ¨: 0003682
āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻ˛āĻŋāĻĒāĻŋ āĻĢā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻāĻ° āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¯āĻāĻ˛āĻžāĻĒ; GO:0003700, GO:0000130
āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻĒāĻĻ āĻ¯ā§āĻ āĻāĻ°āĻžāĻ° āĻĒāĻ°ā§, āĻāĻāĻŋ āĻāĻ āĻŽāĻ¤ āĻĻā§āĻāĻžāĻŦā§:
%āĻĄāĻŋāĻāĻ¨āĻ āĻŦāĻžāĻāĻ§āĻžāĻ ; āĻ¯āĻžāĻ¨: 0003677
% āĻā§āĻ°ā§āĻŽāĻžāĻāĻŋāĻ¨ āĻŦāĻžāĻāĻ§āĻžāĻ; āĻ¯āĻžāĻ¨: 0003682
āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻ˛āĻŋāĻĒāĻŋ āĻĢā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻāĻ° āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¯āĻāĻ˛āĻžāĻĒ; GO:0003700 ; āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻļāĻŦā§āĻĻ:GO:0000130
@āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ:Z-OTHER-DNA āĻŦāĻžāĻāĻ§āĻžāĻ ; slim_temp_id:12
āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ° āĻļāĻ°ā§āĻ¤āĻžāĻŦāĻ˛ā§ āĻ¯āĻž āĻĄāĻŋāĻāĻ¨āĻ āĻŦāĻžāĻāĻ§āĻžāĻāĻ¯āĻŧā§āĻ° āĻ āĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ¸āĻ¨ā§āĻ¤āĻžāĻ¨, āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨ āĻāĻāĻ-
āĻ¸ā§āĻā§āĻ°ā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻĄā§āĻĄ āĻĄāĻŋāĻāĻ¨āĻ āĻŦāĻžāĻāĻ¨ā§āĻĄāĻŋāĻ āĻāĻŦāĻ āĻāĻ° āĻĄāĻŋāĻ¸ā§āĻ¨ā§āĻĄā§āĻ¨ā§āĻāĻ°āĻž āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻāĻžāĻ°ā§āĻŽā§ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻāĻ°āĻŦā§āĨ¤
āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻļāĻŦā§āĻĻāĻāĻŋāĻ¤ā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻāĻāĻĄāĻŋ āĻ°āĻ¯āĻŧā§āĻā§ āĻ¯āĻž āĻā§āĻˇāĻŖāĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¯āĻŧā§ āĻāĻŦāĻ āĻļā§āĻ§ā§āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° āĻ¸ā§āĻŦāĻŋāĻ§āĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ°āĻ¯āĻŧā§āĻā§
āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŋāĻ. āĻāĻāĻŋ āĻŦāĻžāĻšā§āĻ¯āĻŋāĻāĻāĻžāĻŦā§ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°āĻž āĻāĻāĻŋāĻ¤ āĻ¨āĻ¯āĻŧāĨ¤
āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻļāĻŦā§āĻĻā§āĻ° āĻāĻĒāĻ¸āĻ°ā§āĻ Z-OTHER āĻāĻā§; Z āĻļāĻŦā§āĻĻāĻāĻŋ āĻ¨āĻŋāĻļā§āĻāĻŋāĻ¤ āĻāĻ°āĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻāĻŋ āĻšā§āĻ¯āĻžāĻ
āĻ¸āĻ°ā§āĻŦāĻĻāĻž āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻžāĻ¨ā§āĻā§āĻ°āĻŽāĻŋāĻ āĻā§āĻ°āĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻ¸āĻžāĻ°ā§ āĻ¸āĻ°ā§āĻŦāĻļā§āĻˇ āĻ¤āĻžāĻ˛āĻŋāĻāĻžāĻā§āĻā§āĻ¤āĨ¤
āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻĒāĻĻ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ˛ā§ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ˛āĻāĻ°āĻŋāĻĻāĻŽ āĻ¸āĻžāĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻ¯ āĻĒāĻ°āĻŋāĻŦāĻ°ā§āĻ¤āĻŋāĻ¤ āĻšāĻ¯āĻŧāĨ¤ āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻļāĻŦā§āĻĻ āĻāĻāĻāĻŋ āĻāĻā§
āĻ āĻ¨ā§āĻ¯ āĻ¸āĻŦ āĻāĻžāĻāĻŦā§āĻ¨ā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻ āĻ¨ā§āĻ¤āĻ°ā§āĻ¨āĻŋāĻšāĻŋāĻ¤ āĻ¸āĻŽā§āĻĒāĻ°ā§āĻ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ¨āĻ¯āĻŧāĨ¤
Do I āĻĒā§āĻ°āĻ¯āĻŧā§āĻāĻ¨ āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻļāĻ°ā§āĻ¤āĻžāĻŦāĻ˛ā§?
āĻāĻāĻāĻžāĻ˛ āĻŦā§āĻļāĻŋāĻ°āĻāĻžāĻ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĢāĻžāĻāĻ˛āĻā§āĻ˛āĻŋ āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻŦāĻž āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¯āĻŧ 'āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ', āĻ āĻ°ā§āĻĨāĻžā§ āĻā§āĻ¨āĻ āĻĢāĻžāĻāĻ āĻ¨ā§āĻāĨ¤
āĻāĻ° āĻŽāĻžāĻ¨ā§ āĻšāĻ˛ -b āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒāĻāĻŋ āĻ˛āĻā§āĻˇāĻŖā§āĻ¯āĻŧ āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻ¨ āĻĢāĻ˛āĻžāĻĢāĻ˛ āĻ¤ā§āĻ°āĻŋ āĻāĻ°āĻŦā§ āĻ¨āĻžāĨ¤ āĻāĻĻāĻžāĻšāĻ°āĻŖ āĻ¸ā§āĻŦāĻ°ā§āĻĒ,
āĻāĻĒāĻ¨āĻŋ āĻĻā§āĻāĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĻ¨ āĻāĻāĻāĻŋ āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻļāĻŦā§āĻĻ OTHER-āĻŦāĻžāĻāĻ¨ā§āĻĄāĻŋāĻ āĻ¤ā§āĻ°āĻŋ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§, āĻāĻ¤ā§ āĻāĻŋāĻā§ āĻā§āĻāĻž āĻ¨ā§āĻ: āĻāĻžāĻ°āĻŖ āĻ¸āĻŦ
GO-āĻ¤ā§ āĻŦāĻžāĻāĻ¨ā§āĻĄāĻŋāĻāĻ¯āĻŧā§āĻ° āĻŦāĻžāĻā§āĻāĻžāĻĻā§āĻ° āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§ āĻāĻĒāĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻĒāĻ¨ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§āĨ¤
āĻŦāĻžāĻ˛āĻ¤āĻŋ āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒāĻāĻŋ āĻ¸āĻ¤ā§āĻ¯āĻŋāĻ āĻļā§āĻ§ā§āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° āĻāĻŋāĻā§ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¨ā§ āĻāĻ°ā§āĻāĻžāĻāĻ āĻāĻ°āĻž āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻĒā§āĻ°āĻ¯āĻŧā§āĻāĻ¨ā§āĻ¯āĻŧ,
āĻ¯āĻž āĻ¸ā§āĻĨāĻŋāĻ° āĻāĻŦāĻ āĻŽā§āĻāĻžāĻŽā§āĻāĻŋ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĄ-āĻšāĻ āĻāĻĒāĻžāĻ¯āĻŧā§ āĻ¤ā§āĻ°āĻŋ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§; āĻ¤āĻžāĻ°āĻž 'āĻĢāĻžāĻāĻ' āĻāĻŽāĻž āĻāĻ°āĻ¤ā§ āĻĨāĻžāĻā§
āĻ¸āĻŽāĻ¯āĻŧā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻ¸āĻžāĻĨā§ (āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨ GO āĻŦāĻžāĻāĻ§āĻžāĻāĻ¯āĻŧā§āĻ° āĻāĻāĻāĻŋ āĻ¨āĻ¤ā§āĻ¨ āĻļāĻŋāĻļā§ āĻ¯ā§āĻ āĻāĻ°āĻŦā§, āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻ¤ā§ āĻ¸ā§āĻā§āĻ¯āĻžāĻāĻŋāĻ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĢāĻžāĻāĻ˛āĻāĻŋ āĻšāĻŦā§ āĻ¨āĻž
āĻ¤āĻžāĻ°āĻŋāĻ, āĻ¤āĻžāĻ āĻāĻ āĻ¨āĻ¤ā§āĻ¨ āĻāĻžāĻ°ā§āĻŽā§ āĻā§āĻāĻž āĻāĻ°āĻž āĻ¯ā§āĻā§āĻ¨ āĻāĻŋāĻ¨ āĻĒā§āĻ°ā§āĻĄāĻžāĻā§āĻ OTHER-āĻŦāĻžāĻāĻ¨ā§āĻĄāĻŋāĻ-āĻ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻāĻ°āĻŦā§
āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž)
āĻāĻŋāĻ¤ā§āĻ°āĻ˛ā§āĻ āĻā§āĻ˛
āĻŽāĻ¨ā§ āĻ°āĻžāĻāĻŦā§āĻ¨ āĻ¯ā§ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ āĻĢāĻžāĻāĻ˛(āĻā§āĻ˛āĻŋ) āĻŦāĻ°ā§āĻ¤āĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĒā§āĻā§āĻˇā§ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¨ā§ āĻšāĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§
āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ
āĻŦāĻ°ā§āĻ¤āĻŽāĻžāĻ¨ā§ map2slim āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻā§āĻ°āĻžāĻĢ āĻāĻŦāĻ āĻā§āĻ°āĻžāĻĢā§āĻ° āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ āĻā§āĻ°āĻžāĻĢā§āĻ° āĻ āĻŽāĻŋāĻ˛āĻā§ āĻĒāĻ¤āĻžāĻāĻžāĻā§āĻāĻŋāĻ¤ āĻāĻ°ā§ āĻ¨āĻž
āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ āĻĢāĻžāĻāĻ˛; āĻāĻāĻŋ āĻŦāĻžāĻ¸ā§āĻ¤āĻŦ āĻā§āĻ°āĻžāĻĢ āĻšāĻŋāĻ¸āĻžāĻŦā§ āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ āĻ¨ā§āĻ¯āĻŧāĨ¤ āĻ¤āĻŦā§
āĻāĻĒāĻ¨āĻŋ āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻŦāĻžāĻāĻ¨ āĻāĻ°āĻ˛ā§ āĻĢāĻ˛āĻžāĻĢāĻ˛ āĻĢāĻ°āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ āĻāĻ°āĻ¤ā§ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°āĻž āĻšāĻŦā§ -t -c āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ āĻšāĻŋāĻ¸āĻžāĻŦā§āĨ¤
āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ
āĻ¸āĻžāĻ§āĻžāĻ°āĻŖ āĻŽā§āĻĄā§, āĻāĻāĻāĻŋ āĻ¸ā§āĻā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻĄāĻžāĻ°ā§āĻĄ āĻĢāĻ°āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ āĻāĻŋāĻ¨-āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ¸ā§āĻ¸āĻŋāĻ¯āĻŧā§āĻļāĻ¨ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻ˛ā§āĻāĻž āĻšāĻŦā§āĨ¤ GO ID āĻāĻ˛āĻžāĻŽ
(5) GO āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻāĻāĻĄāĻŋ āĻĨāĻžāĻāĻŦā§āĨ¤ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŋāĻ āĻā§āĻŦāĻŋāĻ˛ā§āĻ° ā§¨āĻ¯āĻŧ āĻāĻ˛āĻžāĻŽā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻŽāĻŋāĻ˛ā§ āĻ¯āĻžāĻ¯āĻŧ
āĻāĻĒāĻ°ā§ āĻŽāĻ¨ā§ āĻ°āĻžāĻāĻŦā§āĻ¨ āĻ¯ā§ āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§ āĻāĻ¨āĻĒā§āĻ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§āĻ° āĻā§āĻ¯āĻŧā§ āĻŦā§āĻļāĻŋ āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻĨāĻžāĻāĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤ āĻāĻ
āĻāĻžāĻ°āĻŖ āĻāĻŋāĻā§ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ GO āĻāĻāĻĄāĻŋāĻ° āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¸āĻā§āĻāĻŋāĻ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻāĻāĻĄāĻŋ āĻĨāĻžāĻā§āĨ¤
COUNT āĻāĻŋ āĻŽā§āĻĄ
map2slim -c āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§ āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§, āĻ¯āĻž āĻ¸ā§āĻŦāĻ¤āĻ¨ā§āĻ¤ā§āĻ° āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻŖāĻ¨āĻž āĻĻā§āĻŦā§
āĻĒāĻŖā§āĻ¯ āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻāĻŋ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻļāĻŦā§āĻĻ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ. āĻāĻ˛āĻžāĻŽāĻā§āĻ˛āĻŋ āĻ¨āĻŋāĻŽā§āĻ¨āĻ°ā§āĻĒ
GO āĻŽā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻĻ
āĻĒā§āĻ°āĻĨāĻŽ āĻāĻ˛āĻžāĻŽāĻāĻŋ āĻšāĻ˛ GO ID āĻāĻŦāĻ āĻ¤āĻžāĻ°āĻĒāĻ°ā§ āĻļāĻŦā§āĻĻā§āĻ° āĻ¨āĻžāĻŽ (āĻļāĻŦā§āĻĻā§āĻ° āĻ¨āĻžāĻŽāĻāĻŋ āĻšāĻŋāĻ¸āĻžāĻŦā§ āĻĻā§āĻāĻ¯āĻŧāĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§ā§ˇ
āĻāĻāĻŋ āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ GO āĻāĻŦāĻ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ āĻ¨āĻā§āĻ˛āĻāĻŋ āĻāĻāĻ¯āĻŧ āĻā§āĻˇā§āĻ¤ā§āĻ°ā§āĻ āĻĒāĻžāĻāĻ¯āĻŧāĻž āĻ¯āĻžāĻ¯āĻŧ - āĻāĻā§āĻ˛āĻŋ āĻ¸āĻžāĻ§āĻžāĻ°āĻŖāĻ¤ āĻāĻāĻ āĻšāĻŦā§
āĻ¤āĻŦā§ āĻŽāĻžāĻā§ āĻŽāĻžāĻā§ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĢāĻžāĻāĻ˛āĻāĻŋ GO āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§āĻ° āĻĒāĻ°āĻŋāĻŦāĻ°ā§āĻ¤āĻ¨ā§āĻ° āĻĒāĻŋāĻāĻ¨ā§ āĻĨāĻžāĻāĻŦā§)
āĻāĻŋāĻ¨ āĻĒāĻŖā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž āĻ¯āĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻŋ āĻ¸āĻŦāĻā§āĻ¯āĻŧā§ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¸āĻā§āĻāĻŋāĻ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻļāĻŦā§āĻĻ
āĻ¸ā§āĻŦāĻ¤āĻ¨ā§āĻ¤ā§āĻ° āĻāĻŋāĻ¨ āĻĒāĻŖā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž āĻ¯āĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻŋ āĻ¸āĻŦāĻā§āĻ¯āĻŧā§ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¸āĻā§āĻāĻŋāĻ/āĻ¸āĻ°āĻžāĻ¸āĻ°āĻŋ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž
āĻāĻāĻĄāĻŋ āĻ¸āĻ°ā§āĻŦāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻ¤ā§āĻ¯āĻā§āĻˇ āĻĻā§āĻŦāĻžāĻ°āĻž āĻāĻŽāĻ°āĻž āĻŦāĻ˛āĻ¤ā§ āĻāĻžāĻā§āĻāĻŋ āĻ¯ā§ āĻšāĻ¯āĻŧ āĻ¸āĻŽāĻŋāĻ¤āĻŋ āĻāĻ āĻļāĻŦā§āĻĻāĻāĻŋ āĻ¸āĻ°āĻžāĻ¸āĻ°āĻŋ āĻ¤ā§āĻ°āĻŋ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§,
āĻ āĻĨāĻŦāĻž āĻ¸āĻŽāĻŋāĻ¤āĻŋ āĻāĻ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻļāĻŦā§āĻĻā§āĻ° āĻāĻāĻāĻŋ āĻļāĻŋāĻļā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧ āĻāĻŦāĻ āĻā§āĻ¨ āĻļāĻŋāĻļā§ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻ¨ā§āĻ
āĻ¯ā§ āĻļāĻŦā§āĻĻāĻāĻŋ āĻ¸āĻŽāĻŋāĻ¤āĻŋ āĻŽāĻžāĻ¨āĻāĻŋāĻ¤ā§āĻ° āĻāĻ°ā§āĨ¤
āĻŦā§āĻļāĻŋāĻ°āĻāĻžāĻ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽāĻĻā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯, āĻāĻ āĻāĻŖāĻ¨āĻž āĻ¸āĻ°āĻžāĻ¸āĻ°āĻŋ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ¸ā§āĻ¸āĻŋāĻ¯āĻŧā§āĻļāĻ¨ā§āĻ° āĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻžāĻ° āĻ¸āĻŽāĻ¤ā§āĻ˛ā§āĻ¯ āĻšāĻŦā§
āĻāĻ āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻļāĻŦā§āĻĻ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ. āĻ¯āĻžāĻāĻšā§āĻ, āĻāĻŋāĻā§ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¨ā§ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ "āĻ¸ā§āĻĒāĻāĻŋ" āĻ¯ā§ āĻ¤āĻžāĻ°āĻž
"āĻļā§āĻ¨ā§āĻ¯āĻ¤āĻž" āĻ¸ā§āĻŦā§āĻāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§āĻ¨āĨ¤ āĻāĻĻāĻžāĻšāĻ°āĻŖāĻ¸ā§āĻŦāĻ°ā§āĻĒ, āĻ¯āĻĻāĻŋ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ "āĻā§āĻŦāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻž" āĻāĻ° āĻ¸āĻŽāĻ¸ā§āĻ¤ āĻļāĻŋāĻļā§ āĻĨāĻžāĻā§
"āĻāĻāĻ°āĻŖ" āĻāĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻ¤āĻŋāĻā§āĻ°āĻŽ āĻ¤āĻžāĻ°āĻĒāĻ° "āĻāĻāĻ°āĻŖ" āĻŦāĻž āĻāĻ° āĻŦāĻžāĻā§āĻāĻžāĻĻā§āĻ° āĻ¸āĻŽāĻ¸ā§āĻ¤ āĻā§āĻāĻž āĻšāĻŦā§
āĻāĻāĻžāĻ¨ā§ āĻāĻŖāĻ¨āĻž āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§
āĻ¨ā§āĻā§āĻ° āĻāĻĻāĻžāĻšāĻ°āĻŖ āĻĻā§āĻā§āĻ¨
āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻļāĻŦā§āĻĻā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻ¯ā§āĻā§āĻ¤ āĻšāĻ¤ā§ āĻ āĻ¨ā§āĻŽāĻžāĻ¨āĻā§āĻ¤ āĻāĻŋāĻ¨ āĻĒāĻŖā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž
āĻāĻŦāĻ āĻ¸ā§āĻŦāĻ¤āĻ¨ā§āĻ¤ā§āĻ° āĻāĻŋāĻ¨ āĻĒāĻŖā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž āĻ¯āĻž āĻāĻ° āĻ¯ā§āĻā§āĻ¨ā§ āĻŦāĻāĻļāĻ§āĻ°ā§āĻ° āĻāĻžāĻā§ āĻā§āĻāĻž āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§
āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻāĻāĻĄāĻŋ (āĻŦāĻž āĻ¸āĻ°āĻžāĻ¸āĻ°āĻŋ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻāĻāĻĄāĻŋāĻ¤ā§ āĻā§āĻāĻž)āĨ¤
āĻ āĻĒā§āĻ°āĻāĻ˛āĻŋāĻ¤ āĻĒāĻ¤āĻžāĻāĻž
āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ¤ā§ āĻ¯āĻžāĻ¨
āĻāĻāĻāĻŋ āĻāĻĻāĻžāĻšāĻ°āĻŖ āĻ¨āĻŋāĻ¤ā§; āĻ¯āĻĻāĻŋ āĻāĻŽāĻ°āĻž āĻāĻāĻāĻžāĻŦā§ -t āĻāĻŦāĻ -c āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°āĻŋ:
map2slim -t -c GO_slims/goslim_generic.obo ontology/gene_ontology.obo gene-associations/gene_association.fb
āĻ¤āĻžāĻ°āĻĒāĻ° āĻĢāĻ˛āĻžāĻĢāĻ˛ā§āĻ° āĻ āĻāĻļ āĻāĻ āĻŽāĻ¤ āĻĻā§āĻāĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§:
GO:0008150 āĻā§āĻŦāĻŋāĻ_āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻž (āĻā§āĻŦāĻŋāĻ_āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻž) 34 10025 āĻā§āĻŦāĻŋāĻ_āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻž
GO:0007610 āĻāĻāĻ°āĻŖ (āĻāĻāĻ°āĻŖ) 632 632 āĻā§āĻŦāĻŋāĻ_āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻž
GO:0000004 āĻā§āĻŦāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻž āĻ āĻāĻžāĻ¨āĻž (āĻā§āĻŦāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻž āĻ āĻāĻžāĻ¨āĻž) 832 832 biological_process
GO:0007154 āĻ¸ā§āĻ˛ āĻāĻŽāĻŋāĻāĻ¨āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨ (āĻ¸ā§āĻ˛ āĻāĻŽāĻŋāĻāĻ¨āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨) 333 1701 biological_process
GO:0008037 āĻ¸ā§āĻ˛ āĻ°āĻŋāĻāĻāĻ¨āĻŋāĻļāĻ¨ (āĻā§āĻˇ āĻ¸ā§āĻŦā§āĻā§āĻ¤āĻŋ) 19 19 āĻā§āĻŦāĻŋāĻ_āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻž
19āĻāĻŋ āĻĒāĻŖā§āĻ¯ GO:0008037 āĻŦāĻž āĻāĻ° āĻāĻāĻāĻŋ āĻ¸āĻ¨ā§āĻ¤āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§ā§ˇ (GO:0008037 āĻšāĻ˛ āĻāĻāĻāĻŋ āĻ˛āĻŋāĻĢ āĻ¨ā§āĻĄ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ, āĻ¤āĻžāĻ āĻĻā§āĻāĻŋ āĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž āĻ āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻ¨)āĨ¤
āĻ āĻ¨ā§āĻ¯āĻĻāĻŋāĻā§, GO:0008150 āĻļā§āĻ§ā§āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° 34āĻāĻŋ āĻĒāĻŖā§āĻ¯ āĻĒāĻžāĻ¯āĻŧ āĻ¯āĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻŋ āĻ¸āĻŦāĻā§āĻ¯āĻŧā§ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¸āĻā§āĻāĻŋāĻ
āĻŽā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻĻ āĻāĻ° āĻāĻžāĻ°āĻŖ āĻšāĻ˛ āĻŦā§āĻļāĻŋāĻ°āĻāĻžāĻ āĻā§āĻāĻžāĻā§āĻ˛āĻŋ GO:0008150-āĻāĻ° āĻāĻŋāĻā§ āĻļāĻŋāĻļā§āĻā§ āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ āĻŦāĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¯āĻŧ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻāĻ°āĻŦā§,
āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨ GO:0007610 (āĻāĻāĻ°āĻŖ)āĨ¤ āĻāĻ 34 āĻāĻŋāĻ¨ āĻĒāĻŖā§āĻ¯ āĻšāĻ¯āĻŧ āĻ¸āĻ°āĻžāĻ¸āĻ°āĻŋ āĻā§āĻāĻž āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧ
GO:0008150, āĻ āĻĨāĻŦāĻž āĻāĻ āĻļāĻŦā§āĻĻā§āĻ° āĻāĻŋāĻā§ āĻļāĻŋāĻļā§āĻ° āĻāĻžāĻā§ āĻ¯āĻž āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻ¨āĻ¯āĻŧāĨ¤ āĻāĻ āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻĻā§āĻļ āĻāĻ°āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĻ¨
āĻĒāĻžāĻ¤āĻ˛āĻž āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ 'āĻĢāĻžāĻāĻ'. āĻŽāĻ¨ā§ āĻ°āĻžāĻāĻŦā§āĻ¨ āĻ¯ā§ -b āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒ2āĻ¸ā§āĻ˛āĻŋāĻŽ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§ āĻāĻ āĻĢāĻžāĻāĻāĻā§āĻ˛āĻŋāĻā§ 'āĻĒā§āĻ˛āĻžāĻ' āĻāĻ°āĻŦā§
āĻā§āĻ¤ā§āĻ°āĻŋāĻŽ āĻĢāĻŋāĻ˛āĻžāĻ° āĻļāĻ°ā§āĻ¤āĻžāĻŦāĻ˛ā§ āĻ¸āĻā§āĻā§.
onworks.net āĻĒāĻ°āĻŋāĻˇā§āĻŦāĻž āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ map2slimp āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§āĻ¨