প্রাইমার্স - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

প্রাইমার - পিসিআর প্রাইমার বাছাই করার জন্য প্রাইমার 3 এর সহজ সংস্করণ

সাইনোপিসিস

primers -ক্রম seqall [-লক্ষ্য অঞ্চল পরিসর] [- ছোট আকার পূর্ণসংখ্যা] [- সর্বোচ্চ আকার পূর্ণসংখ্যা]
[-maxdifftm ভাসা] [-পতাকা ব্যাখ্যা করুন বুলিয়ান] [-সংখ্যা ফেরত পূর্ণসংখ্যা] -আউটফাইল আউটফাইল

primers -হেল্প

বর্ণনাঃ

primers এটি EMBOSS এর একটি কমান্ড লাইন প্রোগ্রাম ("ইউরোপীয় আণবিক জীববিজ্ঞান ওপেন
সফটওয়্যার স্যুট"). এটি "নিউক্লিক: প্রাইমারস" কমান্ড গ্রুপ(গুলি) এর অংশ।

বিকল্প

ইনপুট অধ্যায়
-ক্রম seqall
যে ক্রম থেকে প্রাইমার বেছে নিতে হবে। ক্রমটি অবশ্যই 5' -> 3' উপস্থাপন করতে হবে

অতিরিক্ত অধ্যায়
-লক্ষ্য অঞ্চল পরিসর
যদি এক বা একাধিক লক্ষ্য নির্দিষ্ট করা থাকে তাহলে একটি আইনি প্রাইমার জোড়া অবশ্যই অন্তত একটির পাশে থাকবে
তাদের মধ্যে. একটি লক্ষ্য একটি সাধারণ ক্রম পুনরাবৃত্তি সাইট হতে পারে (উদাহরণস্বরূপ একটি CA পুনরাবৃত্তি) বা
একটি একক-বেস-জোড়া পলিমারফিজম। মানটি একটি স্থান-বিচ্ছিন্ন তালিকা হওয়া উচিত
, জোড়া যেখানে একটি লক্ষ্যের প্রথম ভিত্তির সূচক এবং
শেষ যেমন 50,51 পজিশন 2 এ 50টি বেসকে ঘিরে রাখতে প্রাইমার প্রয়োজন
এবং এক্সএনএমএক্স।

- ছোট আকার পূর্ণসংখ্যা
একটি প্রাইমারের ন্যূনতম গ্রহণযোগ্য দৈর্ঘ্য। 0-এর থেকে বড় এবং কম বা সমান হতে হবে৷
MAX-SIZE পর্যন্ত। ডিফল্ট মান: 18

- সর্বোচ্চ আকার পূর্ণসংখ্যা
একটি প্রাইমারের সর্বাধিক গ্রহণযোগ্য দৈর্ঘ্য (ঘাঁটিগুলিতে)। বর্তমানে এই পরামিতি হতে পারে না
35 এর থেকে বড়। এই সীমাটি সর্বাধিক অলিগো আকার দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয় যার জন্য প্রাইমার 3 এর
গলনা-তাপমাত্রা বৈধ। ডিফল্ট মান: 27

-maxdifftm ভাসা
সর্বাধিক গ্রহণযোগ্য (স্বাক্ষরবিহীন) এর গলে যাওয়া তাপমাত্রার মধ্যে পার্থক্য
ফরোয়ার্ড এবং রিভার্স প্রাইমার। ডিফল্ট মান: 100.0

আউটপুট অধ্যায়
-পতাকা ব্যাখ্যা করুন বুলিয়ান
যদি এই পতাকাটি অ-0 হয়, তাহলে বাম-ব্যাখ্যা এবং ডান-ব্যাখ্যা, আউটপুট তৈরি করুন, যা হল
প্রাইমার 3 পরীক্ষা করা প্রাইমার জোড়ার সংখ্যা সম্পর্কে তথ্য প্রদানের উদ্দেশ্যে,
এবং সংখ্যার পরিসংখ্যান বিভিন্ন কারণে বাতিল। ডিফল্ট মান: N

-সংখ্যা ফেরত পূর্ণসংখ্যা
প্রত্যাবর্তনের জন্য সর্বাধিক সংখ্যক প্রাইমার জোড়া। প্রত্যাবর্তিত প্রাইমার জোড়া অনুসারে সাজানো হয়
তাদের 'গুণ', অন্য কথায় উদ্দেশ্য ফাংশনের মান দ্বারা (যেখানে একটি নিম্ন
সংখ্যা একটি ভাল প্রাইমার জোড়া নির্দেশ করে)। সতর্কতা: এই প্যারামিটারটিকে একটি বড় করে সেট করুন
মান চলমান সময় বৃদ্ধি হবে. ডিফল্ট মান: 5

-আউটফাইল আউটফাইল

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইন প্রাইমার ব্যবহার করুন