GoGPT Best VPN GoSearch

অনওয়ার্কস ফেভিকন

TransDecoder.Predict - ক্লাউডে অনলাইন

ট্রান্সডেকোডার চালান। উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটরের মাধ্যমে OnWorks বিনামূল্যে হোস্টিং প্রদানকারীতে পূর্বাভাস দিন

এটি TransDecoder. Predict কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।

কার্যক্রম:

NAME এর


ট্রান্সডিকোডার - ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রোটিন পূর্বাভাস

, USAGE


আবশ্যক:

-টি transscripts.fasta

সাধারণ বিকল্প:

-- ধরে রাখা_লং_অরফস অন্য কোনো প্রমাণ না থাকলেও এই বহু নিউক্লিওটাইডের চেয়ে সমান বা দীর্ঘ পাওয়া সমস্ত ORF ধরে রাখুন
এটিকে কোডিং হিসাবে চিহ্নিত করে (ডিফল্ট: 900 bp => 300aa)

--পেফাম_হিটগুলি ধরে রাখুন অনুসন্ধান করতে /path/to/pfam_db.hmm
hmmscan ব্যবহার করে (যা আপনার PATH সেটিং এর মাধ্যমে অ্যাক্সেসযোগ্য হওয়া উচিত)

-- ধরে রাখা_ব্লাস্ট_হিট

উন্নত বিকল্প

--ট্রেন প্রোটিন শনাক্তকরণের জন্য মার্কভ মডকে প্রশিক্ষণ দিতে ORF-এর সাথে FASTA ফাইল; অন্যথায়
দীর্ঘতম অ-অপ্রয়োজনীয় ORF ব্যবহার করা হয়

-টি যদি না হয় --ট্রেন, মার্কভ মডেলকে প্রশিক্ষণ দেওয়ার জন্য শীর্ষ দীর্ঘতম ওআরএফগুলি (হেক্সামার পরিসংখ্যান) (ডিফল্ট: 500)

2015-12-28 TRANSDECODER.PREDICT(1)

TransDecoder ব্যবহার করুন। onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে ভবিষ্যদ্বাণী করুন


বিনামূল্যে সার্ভার এবং ওয়ার্কস্টেশন

উইন্ডোজ এবং লিনাক্স অ্যাপ ডাউনলোড করুন

লিনাক্স কমান্ডগুলি

Ad




×
ভি .আই. পি  বিজ্ঞাপন
❤️এখানে কেনাকাটা করুন, বুক করুন, অথবা কিনুন — বিনামূল্যে, পরিষেবাগুলি বিনামূল্যে রাখতে সাহায্য করে।