এটি হল GMcloser নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশ GMcloser-1.6.2.tar.gz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
অনওয়ার্কস সহ GMcloser নামের এই অ্যাপটি বিনামূল্যে অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
জিএমক্লোজার
Ad
বর্ণনাঃ
জিএমক্লোজার স্ক্যাফোল্ড অ্যাসেম্বলিতে উপস্থিত শূন্যস্থান পূরণ করে এবং বন্ধ করে, বিশেষ করে পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং (এনজিএস) রিড সহ পুরো জিনোমের ডি নভো অ্যাসেম্বলি দ্বারা উত্পন্ন হয়। অন্যান্য গ্যাপ-ক্লোজিং টুলের বিপরীতে যা শুধুমাত্র এনজিএস রিড ব্যবহার করে, জিএমক্লোজার ফাঁক বন্ধ করার জন্য সিকোয়েন্স হিসেবে প্রি-অ্যাসেম্বল করা কনটিগ সেট বা লং রিড সেট ব্যবহার করে এবং ফাঁকের নির্ভুলতা এবং দক্ষতা উন্নত করতে পেয়ারড-এন্ড (PE) রিড এবং একটি সম্ভাবনা-ভিত্তিক অ্যালগরিদম ব্যবহার করে। বন্ধ বিভিন্ন কনটিগ সেটের সাথে ক্রমাগত চিকিত্সার মাধ্যমে গ্যাপ ক্লোজারের কার্যকারিতা বাড়ানো যেতে পারে।একটি সহিত প্যাকেজ, GMvalue, একটি টুল যা কনটিগ এবং স্ক্যাফোল্ডে মিসঅ্যাসেম্বলি সাইটগুলি নির্ধারণ করার জন্য। অন্যান্য সম্পর্কিত সরঞ্জামগুলির বিপরীতে, GMvalue বিভিন্ন বিকল্পের সাথে মিসঅ্যাসেম্বলি বিভাগগুলিকে সংজ্ঞায়িত করতে পারে এবং একটি বড় আকারের জিনোমের সমাবেশগুলিতে প্রয়োগ করা যেতে পারে। -e বিকল্পটি ব্যবহার করে, GMvalue মিসসেম্বলগুলিকে বিভক্ত বা সংশোধন করে ত্রুটি-মুক্ত সমাবেশগুলি তৈরি করে।
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/gmcloser/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
