এটি ক্যালিস্টো নামের একটি লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজটি kallisto_windows-v0.50.0.zip হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
বিনামূল্যের OnWorks-এর সাথে kallisto নামের এই অ্যাপটি অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
ক্যালিস্টো
বর্ণনাঃ
ক্যালিস্টো হল RNA-Seq ডেটা থেকে ট্রান্সক্রিপ্ট প্রাচুর্যের কাছাকাছি-অনুকূল পরিমাণ নির্ধারণের জন্য একটি প্রোগ্রাম, বা আরও সাধারণভাবে উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং রিড ব্যবহার করে টার্গেট সিকোয়েন্সের। এটি পঠন এবং লক্ষ্যগুলির সামঞ্জস্যতা দ্রুত নির্ধারণ করতে সিউডোঅ্যালাইনমেন্ট ব্যবহার করার ধারণার উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছে, কোন প্রান্তিককরণের প্রয়োজন নেই।
একটি ম্যাক ডেস্কটপ কম্পিউটারে করা বেঞ্চমার্ক অনুসারে, ক্যালিস্টো 30 মিনিটেরও কম সময়ের মধ্যে 3 মিলিয়ন মানুষের বাল্ক RNA-seq রিডের পরিমাপ করতে পারে শুধুমাত্র রিড সিকোয়েন্স এবং একটি ট্রান্সক্রিপ্টোম ইনডেক্স, যেটি তৈরি করতে 10 মিনিটেরও বেশি সময় লাগতে পারে। এবং যেহেতু এটি সিউডোঅ্যালাইনমেন্ট ব্যবহার করে, তাই এটি পাঠে ত্রুটির জন্য শক্তিশালী এবং পরিমাণ নির্ধারণের জন্য প্রয়োজনীয় মূল তথ্য সংরক্ষণ করে। এটি ক্যালিস্টোকে শুধু দ্রুতই নয়, অত্যন্ত নির্ভুলও করে তোলে। অনেক বেঞ্চমার্কে, এটি বিদ্যমান সরঞ্জামগুলিকেও ব্যাপকভাবে ছাড়িয়ে যায়।
বৈশিষ্ট্য
- ছদ্ম বিন্যাস ব্যবহার করে
- দ্রুত এবং সঠিক
- কোয়ান্টিফাইড বাল্ক RNA-Seq sleuth দিয়ে বিশ্লেষণ করা যেতে পারে
- একক-কোষ RNA-seq ডেটা প্রাক-প্রক্রিয়া করতে bustools ব্যবহার করা যেতে পারে
প্রোগ্রামিং ভাষা
C
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
