āĻāĻāĻŋ āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻā§āĻ¸ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ ParamIT āĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ° āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻā§āĻ¸ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻ¯āĻžāĻ° āĻ¸āĻ°ā§āĻŦāĻļā§āĻˇ āĻĒā§āĻ°āĻāĻžāĻļ ParamITPack-1.0.tar.bz2 āĻšāĻŋāĻ¸āĻžāĻŦā§ āĻĄāĻžāĻāĻ¨āĻ˛ā§āĻĄ āĻāĻ°āĻž āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤ āĻāĻāĻŋ āĻāĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻāĻ¸ā§āĻā§āĻļāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§āĻ° āĻšā§āĻ¸ā§āĻāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨āĻāĻžāĻ°ā§ OnWorks-āĻ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§ āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤
āĻĄāĻžāĻāĻ¨āĻ˛ā§āĻĄ āĻāĻ°ā§āĻ¨ āĻāĻŦāĻ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ ParamIT āĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ° āĻāĻ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻāĻŋ āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§ OnWorks-āĻāĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ Linux-āĻ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯āĨ¤
āĻāĻ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻāĻŋ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻ āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻĻā§āĻļāĻžāĻŦāĻ˛ā§ āĻ āĻ¨ā§āĻ¸āĻ°āĻŖ āĻāĻ°ā§āĻ¨:
- 1. āĻāĻĒāĻ¨āĻžāĻ° āĻĒāĻŋāĻ¸āĻŋāĻ¤ā§ āĻāĻ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨āĻāĻŋ āĻĄāĻžāĻāĻ¨āĻ˛ā§āĻĄ āĻāĻ°ā§āĻ¨ā§ˇ
- 2. āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻāĻžāĻ°ā§ āĻĒā§āĻ°āĻŦā§āĻļ āĻāĻ°ā§āĻ¨ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX āĻāĻĒāĻ¨āĻŋ āĻ¯ā§ āĻāĻāĻāĻžāĻ°āĻ¨ā§āĻŽ āĻāĻžāĻ¨āĨ¤
- 3. āĻāĻ āĻ§āĻ°āĻ¨ā§āĻ° āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻāĻžāĻ°ā§ āĻāĻ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨āĻāĻŋ āĻāĻĒāĻ˛ā§āĻĄ āĻāĻ°ā§āĻ¨āĨ¤
- 4. āĻāĻ āĻāĻ¯āĻŧā§āĻŦāĻ¸āĻžāĻāĻ āĻĨā§āĻā§ OnWorks Linux āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻŦāĻž Windows āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦāĻž MACOS āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻļā§āĻ°ā§ āĻāĻ°ā§āĻ¨āĨ¤
- 5. OnWorks Linux OS āĻĨā§āĻā§ āĻāĻĒāĻ¨āĻŋ āĻāĻāĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° āĻļā§āĻ°ā§ āĻāĻ°ā§āĻā§āĻ¨, āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻāĻžāĻ°ā§ āĻ¯āĻžāĻ¨ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX āĻāĻĒāĻ¨āĻžāĻ° āĻĒāĻāĻ¨ā§āĻĻā§āĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°āĻāĻžāĻ°ā§āĻ° āĻ¨āĻžāĻŽ āĻ¸āĻšāĨ¤
- 6. āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨āĻāĻŋ āĻĄāĻžāĻāĻ¨āĻ˛ā§āĻĄ āĻāĻ°ā§āĻ¨, āĻāĻāĻŋ āĻāĻ¨āĻ¸ā§āĻāĻ˛ āĻāĻ°ā§āĻ¨ āĻāĻŦāĻ āĻāĻāĻŋ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨āĨ¤
āĻ¸ā§āĻā§āĻ°ā§āĻ¨āĻļāĻāĻā§āĻ˛āĻŋ
Ad
āĻĒāĻžāĻ°āĻŽāĻŋāĻāĻŋ āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻā§āĻ¸ā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯
āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻžāĻ
ParamIT āĻšāĻ˛ āĻāĻāĻāĻŋ āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ āĻ¯āĻž CHARMM āĻā§āĻ¨āĻžāĻ°ā§āĻ˛ āĻĢā§āĻ°ā§āĻ¸ āĻĢāĻŋāĻ˛ā§āĻĄ (CGenFF) āĻĒā§āĻ°ā§āĻā§āĻāĻ˛ā§āĻ° āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ āĻā§āĻ, āĻĄā§āĻ°ā§āĻ¯āĻžāĻ āĻ˛āĻžāĻāĻ, āĻ āĻŖā§āĻā§āĻ˛āĻŋāĻ° āĻāĻŖāĻŦāĻŋāĻ āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻ¤ā§āĻ°āĻŋāĻ āĻŦāĻ˛ āĻā§āĻˇā§āĻ¤ā§āĻ°ā§āĻ° āĻĒā§āĻ¯āĻžāĻ°āĻžāĻŽāĻŋāĻāĻžāĻ°āĻžāĻāĻā§āĻļāĻ¨ā§āĻ° āĻŦāĻŋāĻāĻžāĻļā§ āĻ¸āĻšāĻžāĻ¯āĻŧāĻ¤āĻž āĻāĻ°ā§āĨ¤ āĻŦāĻŋāĻāĻļāĻŋāĻ¤ āĻā§āĻ˛āĻāĻŋāĻ āĻāĻŦā§āĻˇāĻāĻĻā§āĻ° āĻ¨āĻŋāĻŽā§āĻ¨āĻ˛āĻŋāĻāĻŋāĻ¤ āĻāĻĒāĻžāĻ¯āĻŧā§ āĻ¸āĻžāĻšāĻžāĻ¯ā§āĻ¯ āĻāĻ°ā§: 1) āĻā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨ā§āĻāĻžāĻŽ āĻāĻŦāĻ āĻāĻŖāĻŦāĻŋāĻ āĻŽā§āĻāĻžāĻ¨āĻŋāĻā§āĻ¸ āĻĒā§āĻ°ā§āĻā§āĻ°āĻžāĻŽā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻāĻ¨āĻĒā§āĻ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻ¤ā§āĻ°āĻŋāĻ° āĻ¸ā§āĻŦāĻ¯āĻŧāĻāĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻ¤āĻž, 2) āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§āĻˇāĻŖ āĻ¸ā§āĻŦāĻ¯āĻŧāĻāĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻāĻ°āĻŖ āĻāĻŦāĻ 3) āĻāĻāĻāĻŋ āĻĻā§āĻ°ā§āĻ¤ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻˇāĻžāĻ¯āĻŧāĻŋāĻ¤ āĻāĻāĻāĻŋ āĻĻāĻŋāĻ¯āĻŧā§ āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ MM āĻĒā§āĻ°ā§āĻā§āĻ°āĻžāĻŽāĻā§āĻ˛āĻŋāĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻĒāĻ¨ āĻāĻ°ā§ā§ˇ āĻāĻ¨ā§āĻ¨āĻ¤ āĻ¸āĻ°āĻā§āĻāĻžāĻŽāĻā§āĻ˛āĻŋāĻ° āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ āĻ°āĻ¯āĻŧā§āĻā§: 1) āĻā§āĻ°āĻžāĻĢāĻŋāĻāĻžāĻ˛ āĻāĻāĻāĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻāĻžāĻ°āĻĢā§āĻ¸ (GUI) āĻ¸āĻš āĻ āĻŖā§-āĻāĻ˛ āĻāĻŽāĻĒā§āĻ˛ā§āĻā§āĻ¸ā§āĻ° āĻā§āĻ¨āĻžāĻ°ā§āĻāĻ°, 2) āĻĒā§āĻ°āĻ¤ā§āĻā§ āĻ¸āĻŽā§āĻāĻžāĻŦā§āĻ¯ āĻļāĻā§āĻ¤āĻŋ āĻŦāĻŋāĻ¤āĻ°āĻŖ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻ°āĻŋāĻā§āĻ¸ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ āĻāĻ§āĻž-āĻ¸ā§āĻŦāĻ¯āĻŧāĻāĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧ āĻĢā§āĻ°āĻŋāĻā§āĻ¯āĻŧā§āĻ¨ā§āĻ¸āĻŋ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§āĻˇāĻŖ āĻāĻŦāĻ āĻ āĻĒā§āĻāĻŋāĻŽāĻžāĻāĻ āĻāĻ°āĻž āĻ āĻā§āĻ¯āĻ¨ā§āĻ¤āĻ°ā§āĻŖ āĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¨āĻžāĻā§āĻā§āĻ° āĻ¤ā§āĻ˛āĻ¨āĻž, 3) āĻ¤āĻŋāĻ¨āĻāĻŋ āĻŽā§āĻĄā§āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻāĻžāĻ°ā§āĻ āĻĢāĻŋāĻāĻŋāĻāĻ¯āĻŧā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ GUI : āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻ˛, āĻŽāĻ¨ā§āĻā§-āĻāĻžāĻ°ā§āĻ˛ā§ āĻ¸ā§āĻ¯āĻžāĻŽā§āĻĒāĻ˛āĻŋāĻ āĻŦāĻž āĻŦā§āĻ°ā§āĻ āĻĢā§āĻ°ā§āĻ¸, āĻāĻŦāĻ 4) āĻĄāĻŋāĻšā§āĻĄā§āĻ°āĻžāĻ˛ āĻāĻžāĻ°ā§āĻŽ āĻĢāĻŋāĻāĻŋāĻ āĻāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ GUIāĨ¤ āĻāĻ āĻ¸āĻ°āĻā§āĻāĻžāĻŽāĻā§āĻ˛āĻŋāĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻļā§āĻ°āĻŽ āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻˇā§āĻāĻžāĻā§ āĻšā§āĻ°āĻžāĻ¸ āĻāĻ°ā§, āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻ˛ āĻāĻ¨āĻĒā§āĻ āĻ¤ā§āĻ°ā§āĻāĻŋāĻā§āĻ˛āĻŋāĻā§ āĻšā§āĻ°āĻžāĻ¸ āĻāĻ°ā§ āĻāĻŦāĻ āĻ¸āĻ āĻŋāĻ MM āĻĒā§āĻ¯āĻžāĻ°āĻžāĻŽāĻŋāĻāĻžāĻ°āĻžāĻāĻā§āĻļāĻ¨ āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻˇā§āĻāĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻĒā§āĻ°āĻ¯āĻŧā§āĻāĻ¨ā§āĻ¯āĻŧ āĻ¸āĻŽāĻ¯āĻŧ āĻšā§āĻ°āĻžāĻ¸ āĻāĻ°ā§āĨ¤āĻĒāĻžāĻ āĻāĻŦāĻ°ā§āĻ
āĻŦāĻŋāĻā§āĻāĻžāĻ¨/āĻāĻŦā§āĻˇāĻŖāĻž
āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°āĻāĻžāĻ°ā§ āĻāĻ¨ā§āĻāĻžāĻ°āĻĢā§āĻ¸
āĻāĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄ āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻāĻžāĻāĻž
āĻĒā§āĻ°ā§āĻā§āĻ°āĻžāĻŽāĻŋāĻ āĻāĻžāĻˇāĻž
āĻ¸āĻŋ, āĻĒāĻžāĻāĻĨāĻ¨
āĻāĻāĻŋ āĻāĻāĻāĻŋ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨ āĻ¯āĻž https://sourceforge.net/projects/paramit/ āĻĨā§āĻā§āĻ āĻāĻ¨āĻž āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤ āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĻāĻŋāĻ āĻ¸āĻŋāĻ¸ā§āĻā§āĻŽāĻā§āĻ˛āĻŋāĻ° āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻĨā§āĻā§ āĻ¸āĻŦāĻā§āĻ¯āĻŧā§ āĻ¸āĻšāĻ āĻāĻĒāĻžāĻ¯āĻŧā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻŋ OnWorks-āĻ āĻšā§āĻ¸ā§āĻ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§āĨ¤